<div dir="ltr">Hi Arjen,<div>    Thanks for your response.  I actually tried both (absolute power and nai).  Both of them are  still opposite when comparing  sensor level to source level.  Besides,  I have  the task  data. It works fine on the contrast.  Therefore, I assume the co-registration is OK in general.  However,  I have no fiducial points in the MRI scans, so I have to select the nas, lpa and rpa with no physical reference.  Therefore , it is possible that the two group have systematic differences in head position. I will check that.</div><div><br></div><div>                                                     All the best,</div><div>                                                      Haiteng  </div><div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Mon, 5 Jan 2015 14:39:25 +0000<br>
From: "Stolk, A. (Arjen)" <<a href="mailto:a.stolk@fcdonders.ru.nl">a.stolk@fcdonders.ru.nl</a>><br>
To: FieldTrip discussion list <<a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl">fieldtrip@science.ru.nl</a>><br>
Subject: Re: [FieldTrip] Opposite DICS Beamforming results on source<br>
        and sensor level on resting state data<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:B1E918C91415AC4B9437A1EEC90D79AFCDBB2E@exprd01.hosting.ru.nl">B1E918C91415AC4B9437A1EEC90D79AFCDBB2E@exprd01.hosting.ru.nl</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hey Haiteng,<br>
<br>
Is your contrast based on absolute signal frequency power? If so, did you check for any systematic differences in headposition (and especially in terms of distance to the sensors - the z-dimension) across the groups? I presume such a systematic difference could yield different results at the sensor- and source-level, but there are probably also other possibilities out there.<br>
<br>
Yours,<br>
Arjen<br>
<br>
--<br>
Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour<br>
Centre for Cognitive Neuroimaging<br>
Radboud University Nijmegen<br>
<br>
Email:  <a href="mailto:a.stolk@donders.ru.nl">a.stolk@donders.ru.nl</a><mailto:<a href="mailto:a.stolk@donders.ru.nl">a.stolk@donders.ru.nl</a>><br>
Phone:  +31(0)243 68294<br>
Web:    <a href="http://www.arjenstolk.nl" target="_blank">www.arjenstolk.nl</a><<a href="http://www.arjenstolk.nl" target="_blank">http://www.arjenstolk.nl</a>><br>
________________________________<br>
From: <a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a> [<a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a>] on behalf of Haiteng Jiang [<a href="mailto:haiteng.jiang@gmail.com">haiteng.jiang@gmail.com</a>]<br>
Sent: Monday, January 05, 2015 3:23 PM<br>
To: <a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl">fieldtrip@science.ru.nl</a><br>
Subject: [FieldTrip] Opposite DICS Beamforming results on source and sensor level on resting state data<br>
<br>
Hi  all,<br>
<br>
   I performed DICS beamforming on resting-state data ( eyes closed) of a clinical population and controls. According to the sensor data,  the control groups have more alpha-band (8-14<br>
Hz) activity over occipital  areas  after cluster statistic (attached figure  upper plot) . Curiously, after beamforming ,  group comparisons showed the reversed patters in visual cortex (attached figure  bottom plot) .Hence, the source-level results are opposite to the sensor-level results. This is *not* a problem of the design matrix, or confusing the groups.  I check  the individual neural  activity index on the single subject level .   They  make sense in general .  I also tune the parameter a lot (tapper, central frequency smooth frequency , regularization  parameter , et al ), the  opposite pattern remains.  I  understand that Beamformer images DO NOT DIRECTLY CORRESPOND TO ANY sensor data.   However, the opposite pattern is really weird.  I noticed that  Tobias Navarro Schr?der had the similar issue 4 years ago (<a href="http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/2011-May/003875.html" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/2011-May/003875.html</a>).  Thus,  I am not the only one who encountered this problem.<br>
<br>
   Any tips and suggestions will be greatly appreciated.  Thanks in advance!<br>
      [cid:ii_i4jxr2sz1_14aba77f4264462a]<br>
<br>
<br>
                                                            Best,<br>
                                                            Hatieng<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
Haiteng Jiang<br>
PhD candidate<br>
Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour<br>
Neuronal Oscillations Group<br>
Computational Cognitive Neuroscience Lab<br>
<a href="https://sites.google.com/site/haitengjiang/" target="_blank">https://sites.google.com/site/haitengjiang/</a><br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20150105/0843735d/attachment.html" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20150105/0843735d/attachment.html</a>><br>
-------------- next part --------------<br>
A non-text attachment was scrubbed...<br>
Name: resting_issues.jpg<br>
Type: image/jpeg<br>
Size: 71312 bytes<br>
Desc: resting_issues.jpg<br>
URL: <<a href="http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20150105/0843735d/attachment.jpg" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20150105/0843735d/attachment.jpg</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<br>
End of fieldtrip Digest, Vol 50, Issue 3<br>
****************************************<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div>Haiteng Jiang </div><div>PhD candidate</div><div>Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour</div><div>Neuronal Oscillations Group </div><div>Computational Cognitive Neuroscience Lab</div></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><a href="https://sites.google.com/site/haitengjiang/" target="_blank">https://sites.google.com/site/haitengjiang/</a></font></div></div></div>
</div></div></div>