<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Hi Nietzsche,<br><br></div>That's much clearer--thanks for your help. It seems as though I should have entered my sources estimates into data.pow.avg rather than data.avg.<br><br></div>However, I am still getting an error.<br><br></div>My data is structured:<br>data = <20x1 cell>                                % one cell array for each participant, n=20<br>data{i}.pos = [902629x3  double]            % x,y,z positions<br>
data{i}.dim = [91 109 91]<br>
data{i}.time = [1 x 11 double]                 % vector of time points<br>
data{i}.pow.avg = [902629 x 11 double]    % source estimates<br><br></div><div>When I try: <br>     grandavgA = ft_sourcegrandaverage(cfg, data{:});<br><br></div><div>I get the error message:<br><br></div><span style="color:rgb(255,0,0)">     ??? Error using ==> ft_checkdata>fixsource at 1259<br>     the input does not contain an avg or trial field<br><br>     Error in ==> ft_checkdata at 650<br>       data = fixsource(data, 'type', sourcerepresentation);<br><br>     Error in ==> ft_sourcegrandaverage at 107<br>       varargin{i} = ft_checkdata(varargin{i}, 'datatype', {'source'}, 'feedback', 'no',<br>       'inside', 'logical', 'sourcerepresentation', 'new');</span><br><br></div>It appears as though the function is searching for a data{i}.avg or data{i}.trial field. What data should these fields contain?<br></div><div>The wiki (<a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/reference/ft_datatype_source">http://fieldtrip.fcdonders.nl/reference/ft_datatype_source</a>) seems to state that these are "historical" fields, although I have updated to fieldtrip-20141030 (the same error also occurs with older versions)<br></div><div><br></div><div>Best,<br></div>Emma<br><br><br><div><div><div><div><div><div><br>On 31 October 2014 16:02, Lam, N.H.L. (Nietzsche) <<a href="mailto:n.lam@fcdonders.ru.nl">n.lam@fcdonders.ru.nl</a>> wrote:<br>> Hi Emma,<br>
><br>
> In this part:<br>> ??? Undefined function or method 'fieldnames' for input arguments of >type 'double'.<br>
><br>
><br>
> Error in ==> parameterselection at 47<br>
>     tmp = fieldnames(data.avg);<br>
><br>
> it says that the function 'fieldnames' doesn't know how to deal with 
data that is of the type <br>> double.  This is because fieldnames expects 
your data to be in the format of a struct.  I'm <br>> guessing there was just 
an error in your implementation because from your message you <br>> understood
 that "input data to ft_sourcegrandaverage contains a cell array of 
structures -- ones <br>> for each participant.  Furthermore, you need to put 
your source estimates in data.pow.avg.<br>
> <br>
> Based on your description, you might try something like this (but it's 
not guaranteed to work <br>> because I'm not entirely sure about the details 
of your data)<br>
> <br>
> data.pos = [902629x3  double]<br>
> data.dim = [91 109 91]<br>
> data.time = [1 x Z double]       %   vector of time points<br>
> data.pow.avg = [902629 x time points]   %   source estimates (or 
potentially voxel x frequency <br>> x time points, depending on your data).<br>
> <br>
> As a side note, the size of your data will be quite taxing on 
computational memory so you <br>> might also want to consider using a lower 
spatial resolution.<br>
> <br>
> Finally, in the future, when describing your data, it would be best to 
show the structure of your <br>> data as shown in matlab (as done above), 
because this makes it easier for everyone else to <br>> see what you've done. 
 Please check this FAQ for more details <a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/how_to_ask_good_questions_to_the_communityhttp://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/how_to_ask_good_questions_to_the_community" target="_blank">http://fieldtrip.fcdonders.nl/</a><br>> <a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/how_to_ask_good_questions_to_the_communityhttp://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/how_to_ask_good_questions_to_the_community" target="_blank">faq/how_to_ask_good_questions_to_the_communityhttp://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/</a><br>> <a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/how_to_ask_good_questions_to_the_communityhttp://fieldtrip.fcdonders.nl/faq/how_to_ask_good_questions_to_the_community" target="_blank">how_to_ask_good_questions_to_the_community</a><br>
> <br>
> Best,<br>
> Nietzsche<br>
<div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><br> </div></div></div>
</div></div></div></div></div></div></div>