<div dir="ltr">Dear All,<div><br></div><div>Sorry for this repetitive email. I realize one I have asked this question before, I couldn't find the email before now, so I was not sure if it were the exact same question. Please ignore this email discussion.</div><div><br></div><div>for those who were wondering here is the previous answer</div><div><br></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">This is the preferred way to do it. Read in all of your data in 1- or</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">2-second epochs at arbitrary points (just one right after another).</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">Run </span><span class="" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">ICA</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"> on these epochs and save the components that you get (call</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">this 'comp'). Then make a note of the components that you want to</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">remove (usually blink, eye movement, and heart). Now read in your data</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">time-locked to your triggers and use the previously-defined components</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">to clean up the data (use the cfg to specify which components you want</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">to remove).</span><br></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.3333330154419px">Again thank is due to Dr. </span><font face="arial, sans-serif">Schurger, and my </font><font face="arial, sans-serif">apologizes</font><font face="arial, sans-serif"> </font></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 30, 2014 at 10:08 AM, Russell G Port <span dir="ltr"><<a href="mailto:russgport@gmail.com" target="_blank">russgport@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi All,<div><br></div><div>I have a question, which I hope someone can help with. Currently I read in my dataset (*.ds) via standard fieldtrip commands, epoching 1 second bins for the length of the data. After proper removal of all jump and muscle artifact, I apply ICA to the resample data (now 300Hz before it was 1200Hz). This is just like fieldtrip's website suggests. Then I verify which components I want to remove via topoplots and coherence in the time domain with the ECG channels. So I now have the list of components that I think are artifact and want removed. Can these components be applied for  rejection onto the same dataset, but differently parsed into epochs, now trials being centered 1 second bins around a trigger? I am trying to see if this works, because I hope if I include more data in the ICA analysis (all data in the dataset) I will get a better components since there are more trials to train the data on, rather than if I based trials around the trigger. I guess what I want to know is if I can get better estimates of my artifacts via using a larger dataset, and then apply then to the same dataset just differently epoched?</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Russ Port</div></div>
</blockquote></div><br></div>