<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div><br></div><div>I've got a question regarding extracting pairwise phase consistency of individual trials for each subject.</div><div><br></div><div>Using the connectivity analyses tutorial as a reference, I extracted the PPC using the fourier information from the mtmfft (dpss taper).</div><div><br></div><div>Here's an example of my code:</div><div><br></div><div><div>    cfg                 = [];</div><div>    cfg.output          = 'fourier';</div><div>    cfg.channel         = {'all'};</div><div>    cfg.method          = 'mtmfft';</div><div>    cfg.keeptrials      = 'yes';</div><div>    cfg.tapsmofrq       = 5;</div><div>    </div><div>    % find the index for the c200 condition</div><div>    pre_c200_idx = find(data8.trialinfo == 200);</div><div>    </div><div>    cfg.trials          = pre_c200_idx;</div><div>    cfg.foilim          = [0 100]; % either the full range of frequencies (data2.hdr.Fs/2) or up to 100 Hz</div><div>    cfg.taper           = 'dpss';</div><div>    HLF_pre_c200        = ft_freqanalysis(cfg, data8);</div></div><div><br></div><div>The PPC is extracted using this code:</div><div><br></div><div><div>    cfg                 = [];</div><div>    cfg.trials          = 'all';</div><div>    cfg.keeptrials      = 'yes';</div><div>    cfg.channel         = {'all'};</div><div>    cfg.removemean      = 'yes';</div><div>    </div><div>    cfg.method           = 'wppc';</div><div>    cfg.channelcmb       = {cfg.channel, cfg.channel};</div><div>    </div><div>    HLF_pre_c200wppc      = ft_connectivityanalysis(cfg, HLF_pre_c200);</div></div><div><br></div><div>Although I've specified to keep individual trials, my output is still a 'chan_freq' dimord variable. It does not contain any individual trial PPC information. Is there a way to extract the connectivity for individual trials?</div><div><br></div><div>Thanks.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Hweeling</div><div><br></div></div>
</div>