<div dir="ltr">Dear Kathrin,<div><br></div><div>Re your previous post about repairing bad channels, I've also tried this on Fieldtrip and it works for me. I've not used the triangulation method, but maybe you could try again. I guess it depends on your template. For me, I was using Easycap 64 channels, but maybe it's different for you. Here's how I set up my repair channels options:</div>
<div><br></div><div><div>    % repairing bad channels with averaged of its neighbours</div><div>    load('/home/leeh/Programs/fieldtrip-20140803/template/layout/easycapM11.mat');</div><div>    </div><div>    cfg_neighb.method = 'template';</div>
<div>    cfg_neighb.layout = lay;</div><div>    neighbours = ft_prepare_neighbours(cfg_neighb, data2);</div><div>    </div><div>    cfg = [];</div><div>    if strcmp('S004', dir_analysis{sub}) == 1</div><div>        cfg.badchannel = {'C4', 'TP9', 'FC4', 'C2', 'F4'};</div>
<div>    end</div><div>    cfg.trials = 'all';</div><div>    cfg.method = 'average';</div><div>    cfg.layout = lay;</div><div>    cfg.neighbours = neighbours;</div><div>    data3 = ft_channelrepair(cfg, data2);</div>
</div><div><br></div><div>Re removing bad channels. Your question regarding if this will create problems for your grand average over subjects later. Well, it depends which channels you remove for individual subjects. As far as I'm aware, when you averaged your data across subjects, it will only pick the common channels across subjects for the statistical analyses. When you plot, you can always call for the template layout (e.g. 'EEG1020.lay'). This will plot the available channels across all subjects, and leave out the ones that are not in the data.</div>
<div><br></div><div>I hope this helps.</div><div><br>Cheers,</div><div>Hweeling</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 17 August 2014 11:23, KatrinH Heimann <span dir="ltr"><<a href="mailto:katrinheimann@gmail.com" target="_blank">katrinheimann@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all<div>I still have problem with the channel interpolation (just not working at all, without error message, see my previous post). Now I am thinking if I just remove the bad channels for the single subjects and leave it like that. My question is though: Will this create problems for my Grand average over subjects later (as in each subject I remove different channels)? and which layout do I have to use to plot my Grand average data later?</div>

<div>Every help is very welcome</div><div>Cheers</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>k</div></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">
=================================================<br>Dr. rer. nat. Lee, Hwee Ling<br>Postdoc<br>German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Bonn<br><br>Email 1: hwee-ling.lee<at><a href="http://dzne.de" target="_blank">dzne.de</a><br>
Email 2: hweeling.lee<at><a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a><div><br></div><div><a href="https://sites.google.com/site/hweelinglee/home" target="_blank">https://sites.google.com/site/hweelinglee/home</a><br>
<br>Correspondence Address:<br>Ernst-Robert-Curtius Strasse 12, 53117, Bonn, Germany<br>=================================================<br></div></div>
</div>