<div dir="ltr">Dear all,
<div><br></div><div>My aim is to use MEG data collected on a neuromag system, perform MNE source analysis and use AAL atlas to extract time series of the anatomical areas. However there seems to be conflicting problems with the coordsys. I tried the following:</div>
<div><br></div><div>1. Kept everything (mri, headmodel, volume) in MNI/SPM coordinate. However, when computing leadfield the gradstruct seems to be in neuromag coordinate. There is no way to change the grad structure from neuromag to spm/mni</div>
<div><br></div><div>2. I tried keeping everything (mri, headmodel, volume) in Neuromag coordinate, and performed source resonstruction. However, to use AAL atlas and source interpolate I need the sources in MNI/SPM coordinates. However, ft_convert_coordsys only supports atlas and mri.</div>
<div><br></div><div>I am not sure how to proceed. Any help would be appreciated.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Raghavan</div><div><br></div></div>