<div dir="ltr">Thanks Max! That helped! I will indeed not do the baseline correction! k</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2014-05-29 12:20 GMT+02:00 Stenner, Max-Philipp <span dir="ltr"><<a href="mailto:max-philipp.stenner@med.ovgu.de" target="_blank">max-philipp.stenner@med.ovgu.de</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Katrin,<br>
<br>
it sounds like you will end up using 'depsamplesT' as your statistic (because you compare repeated measures = 2 consecutive time intervals from the same subject or trial) - why do you need to use baseline-correction then? The pairing should already account for differences in baseline power between subjects (or trials). If you do need a baseline correction, I would not choose such a short baseline in the frequency domain, but go for an average over a much longer (.5 to 1 second) interval, particularly if you intend to baseline-correct single trials (because a short baseline is more likely to project noise from the baseline into your interval of interest). Also, keep in mind that ft_freqanalysis computes power across a time window (specified by you in cfg.t_ftimwin), so that power between -.1 and 0 may not only reflect "baseline" power.<br>

<br>
Best<br>
<br>
Max<br>
<br>
<br>
<br>
________________________________<br>
<br>
Von: <a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a> [<a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a>]" im Auftrag von "KatrinH Heimann [<a href="mailto:katrinheimann@gmail.com">katrinheimann@gmail.com</a>]<br>

Gesendet: Donnerstag, 29. Mai 2014 11:55<br>
An: FieldTrip discussion list<br>
Betreff: [FieldTrip] which baseline correction to choose for frequency analysis<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
Hey together,<br>
another rather conceptual question:<br>
I am wondering about the baselinecorrection for the frequencyanalysis.<br>
I want to compare two timeperiods of one second each, lying right after each other.<br>
In the preprocessing I have baseline corrected them using 100 ms before the first piece (last part of a fixationcross period).<br>
Do I use the same part for the frequencyanalysis? Will say, do I run the analysis let's say from -0.5 (0 point is end of fixation cross) to 2.5 s, correcting with [-0.1 0] and then extract the two different conditions by statistical extraction (each 1 second long) ? Or do I run two analysis on (a bit more than) one second each, using the whole trial as baseline?<br>

<br>
thanks a lot for your advice again! Best<br>
Katrin<br>
<br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>