
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

</head>

<body dir="auto">

<div>Hey Julian,</div>

<div><br>

</div>

<div>That sounds good, it would be awesome if you could give me an example.</div>

<div><br>

</div>

<div>Also though, what are the steps of using ft_prepare_layout with beamformer data. I am away it gives you permissions, but how do you enter that into ft_prepare_layout.</div>

<div><br>

</div>

<div>This is only for using in trentool, otherwise I would be using your method</div>

<div><br>

</div>

<div>Tyler <br>

<br>

</div>

<div><br>

On 23 May 2014, at 4:40 pm, "Julian Keil" <<a href="mailto:julian.keil@gmail.com">julian.keil@gmail.com</a>> wrote:<br>

<br>

</div>

<blockquote type="cite">

<div><base href="x-msg://8/">Dear Tyler,

<div><br>

</div>

<div>I recently had a similar problem.</div>

<div><br>

</div>

<div>I solved this by plotting the x,y,z-coordinates of all dipoles within the BEM-Model and assign a color value depending on the power value to the dipole markers.</div>

<div><br>

</div>

<div>In short: use ft_triplot to plot the mesh of the BEM. Then select the .pos-field of the dipoles inside your volume and plot them with plot3.</div>

<div>In the plot3-step, you can assign each dipole a 'Color'-property based on your power or stats value.</div>

<div><br>

</div>

<div>Alternatively, you can use ft_prepare_layout to get a planar projection of your sources, but at least in my case it did not look too good.</div>

<div><br>

</div>

<div>Hope that helps, if you want to, I can send you an example of what the plots look like.</div>

<div><br>

</div>

<div>Best,</div>

<div><br>

</div>

<div>Julian</div>

<div> </div>

<div>

<div>

<div>Am 23.05.2014 um 04:10 schrieb Tyler Grummett:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; ">

<div dir="ltr">

<div id="OWAFontStyleDivID" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; ">

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">Hello fieldtrippers,<br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; "><br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">I am trying to create a layout file that has the positions of the beamformer sources.<br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; "><br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">The output of my beamformer analysis was 1400 channels and I am trying to create a layout file with certain position which correspond to certain sources.<br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; "><br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">For example, if I wanted to plot 30 sources and all I had were the x y z position.<br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; "><br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">I am hoping that this made sense, I cant quite work out what I should be asking for. I have worked out how to plot the power of the sources, but <br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">ft_topoplotIC is asking for a layout file (after I ran an ICA over it), which I cant work out how to make.<br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; "><br>

</div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; ">Tyler<br>

</div>

<div>

<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; "><br>

</div>

<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">

<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px; ">

<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px; ">

<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px; ">

<div style="font-size: 13px; ">*************************

<div style="font-family: Tahoma; "><br>

</div>

<div><font face="Arial"><i>Tyler Grummett ( BBSc, BSc(Hons I))</i></font></div>

<div><font face="Arial"><i>PhD Candidate</i></font></div>

<div><font face="Arial"><i>Brain Signals Laboratory</i></font></div>

<div><font face="Arial"><i>Flinders University</i></font></div>

<div><font face="Arial"><i>Rm 5A301</i></font></div>

<div><font face="Arial"><i>Ext 66124</i></font></div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

_______________________________________________<br>

fieldtrip mailing list<br>

<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>

<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></div>

</span></blockquote>

</div>

<br>

</div>

</div>

</blockquote>

<blockquote type="cite">

<div><span>_______________________________________________</span><br>

<span>fieldtrip mailing list</span><br>

<span><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a></span><br>

<span><a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></span></div>

</blockquote>

</body>

</html>