<div dir="ltr">Dear <span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:14px">Jörn </span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:14px"><br></span></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px">Thank you for your kind reply. </span></font></div>
<div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px">Now I think I can approach for the better way.</span></font></div><div>
<font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px">Actually I am a novice, and trying to learn about the MATLAB, and the fieldtrip. :)</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px">So far, I have processed step by step, and now I will consider the multiple comparison issue. </span></font></div>
<div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px">Anyway, thank you again. </span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px"><br>
</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px">With regards.</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px"><br>
</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:14px"><br></span></font></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2014-03-19 23:28 GMT+09:00 "Jörn M. Horschig" <span dir="ltr"><<a href="mailto:jm.horschig@donders.ru.nl" target="_blank">jm.horschig@donders.ru.nl</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi BeomJun Min,<div class=""><br>
<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
I think that each 5 values correspond with the frequency data point.<br>
</blockquote></div>
yes, that;s correct.<div class=""><br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
Is that script suitable for the test for the significance, especially avgovertime option 'yes'?<br>
</blockquote></div>
Yes and no. Yes, because you are testing for significance and, depending on what hypothesis you have, averaging over time is perfectly fine. Use avgovertime if you are looking for an effect independent of time, otherwise set it to 'no'. No, because you should pay attention to why selecting this time-frequency region. Now it seems that you selected frequency and time window based on eyeballing the data. If you have no apriori hypothesis about these frequencies and time window, it's a faulty approach to just select the region that shows the strongest approach and do a statistical test. You should take the whole time-window and whole freuqency spectrum (narrowed down as much as apriori hypotheses allow). If this is a real effect it is likely that a proper statistical test will show up only around that time-frequency.<div class="">
<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
If I change the avgovertime option to 'no', then can I found the p-values for each frequencies(5 values), and each time point(51 values), in total 255 values that could have multiple comparison issue?<br>
</blockquote></div>
Yes, you have this problem, is there a reason why you are not using the cluster-based permutation test (or any other correction for multiple comparison which is implemented by setting the cfg.correctm parameter accordingly)?<div class="">
<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
And I thought the 'mask' values of 0 indicates 'statistically non-significance'. Is that right?<br>
</blockquote></div>
Yes, that is correct.<br>
<br>
Best,<br>
Jörn<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="">
<br>
-- <br>
BeomJun Min, M.D.<br>
<br>
Department of Medical System Engineering (DMSE)<br>
Gwangju Institute of Science and Technology (GIST)<br>
261 Cheomdan-gwagiro(Oryong-dong), Buk-gu, Gwangju<br>
500-712, Republic of Korea (South)<br>
Phone: +82-62-715-3266 / Fax: +82-62-715-3244<br></div>
E-mail: <a href="mailto:mbj0310@gmail.com" target="_blank">mbj0310@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:mbj0310@gmail.com" target="_blank">mbj0310@gmail.com</a>>, <a href="http://bmssa.gist.ac.kr" target="_blank">http://bmssa.gist.ac.kr</a> <<a href="http://bmssa.gist.ac.kr/" target="_blank">http://bmssa.gist.ac.kr/</a>><br>

<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/<u></u>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</blockquote>
<br>
<br>
-- <br>
Jörn M. Horschig<br>
PhD Student<br>
Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour<br>
Centre for Cognitive Neuroimaging<br>
Radboud University Nijmegen<br>
Neuronal Oscillations Group<br>
FieldTrip Development Team<br>
<br>
P.O. Box 9101<br>
NL-6500 HB Nijmegen<br>
The Netherlands<br>
<br>
Contact:<br>
E-Mail: <a href="mailto:jm.horschig@donders.ru.nl" target="_blank">jm.horschig@donders.ru.nl</a><br>
Tel:    +31-(0)24-36-68493<br>
Web: <a href="http://www.ru.nl/donders" target="_blank">http://www.ru.nl/donders</a><br>
<br>
Visiting address:<br>
Trigon, room 2.30<br>
Kapittelweg 29<br>
NL-6525 EN Nijmegen<br>
The Netherlands<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/<u></u>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">BeomJun Min, M.D.</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div>
<font face="arial, helvetica, sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px">Department of Medical System Engineering (DMSE)<br></span><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px">Gwangju Institute of Science and Technology (GIST)</span><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px"> </span><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px"><br>
261 Cheomdan-gwagiro(Oryong-dong), Buk-gu, Gwangju <br>500-712, Republic of Korea (South) <br>Phone: +82-62-715-3266 / Fax: +82-62-715-3244 <br>E-mail: </span><a href="mailto:mbj0310@gmail.com" style="text-decoration:none;line-height:18px" target="_blank"><span>mbj0310@gmail.com</span></a><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px">, <a href="http://bmssa.gist.ac.kr/" style="text-decoration:none" target="_blank">http://bmssa.gist.ac.kr</a></span></font><br>
</div></div>
</div>