<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>I'm trying to plot the grand average of a source analysis. However no matter what I try, the result of ft_sourcegrandaverage keeps giving me only the functional data, no anatomy.</div>
<div><br></div><div>My cfg for ft_sourceplot is:</div><div><br></div><div><div>cfg = [];</div><div>cfg.method        = 'ortho';</div><div>cfg.interactive   = 'no';</div><div>cfg.funparameter  = 'avg.pow';</div>
<div>cfg.maskparameter = cfg.funparameter;</div><div>cfg.funcolorlim   = [0 0.2];</div><div>cfg.opacitylim    = [0 0.2];</div><div>cfg.opacitymap    = 'rampup';</div><div><br></div><div>ft_sourceplot(cfg,grandavg{1})</div>
<div><br></div><div>I thus created my own grandaverage, like this (where sourceDiffAll{:,:} is a subject-by-condition cell structure):</div><div><br></div><div><div>temp = zeros([length(nsubjects) size(sourceDiffAll{1,1}.avg.pow)]);</div>
<div>for s=1:length(nsubjects)</div><div>    temp(s,:,:,:) = sourceDiffAll{s,2}.avg.pow - sourceDiffAll{s,1}.avg.pow; % create condition contrast</div><div>end</div><div>customavg = sourceDiffAll{1,1}; % just copy one subject one condition</div>
<div>customavg.avg.pow = squeeze(mean(temp,1)); % and replace power with the grand average power condition-contrast</div></div><div><br></div><div>Now using ft_sourceplot on customavg works just fine.</div><div>Any idea of what's going wrong with ft_sourceplot on ft_sourcegrandaverage?</div>
<div>Thanks!</div><div><br></div><div>- Joram</div><div><br></div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">Joram van Driel, MSc.<div>PhD student @ University of Amsterdam</div><div>Brain & Cognition @ Department of Psychology</div>
</div>
</div></div>