<div dir="ltr">Dear Jim,<div><br></div><div>Thanks. I did try the file as a text file, but it didn't work previously. I'll download the latest version of Fieldtrip tomorrow, and try again.</div><div><br></div><div>
Thanks again!</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Hweeling</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 22 January 2014 16:43, Herring, J.D. (Jim) <span dir="ltr"><<a href="mailto:j.herring@fcdonders.ru.nl" target="_blank">j.herring@fcdonders.ru.nl</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Dear Hweeling,<u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal">
<span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">First of all you should rename the file to 128Channel.txt, if you use the .sfp extension Fieldtrip will recognize it as a different filetype. <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Furthermore, I just noticed that there is a bug in ft_read_sens. It tries to convert the channel label to a double, which is of course not possible and not wanted in case of channel labels.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">The bug will be fixed a.s.a.p. so you should be able to download the updated version by tomorrow, if I am not mistaken.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Best,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Jim  <u></u><u></u></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #b5c4df 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in"><p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Hwee Ling Lee [mailto:<a href="mailto:hweeling.lee@gmail.com" target="_blank">hweeling.lee@gmail.com</a>] <br>
<b>Sent:</b> woensdag 22 januari 2014 16:18<br><b>To:</b> Herring, J.D. (Jim)<br><b>Cc:</b> FieldTrip discussion list<br><b>Subject:</b> Re: [FieldTrip] BrainProducts Easycap layout<u></u><u></u></span></p></div><div><div class="h5">
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><div><p class="MsoNormal">Dear all,<u></u><u></u></p><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">Thanks for the suggestions. For Jörn, I checked the Fieldtrip/template/layout, but none of them fits my data. I tried the suggestion from Herring, however, I keep getting an error message:<u></u><u></u></p>
</div><div><div><p class="MsoNormal">Error using ft_convert_units (line 121)<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">cannot determine geometrical units<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div><div><p class="MsoNormal">Error in ft_datatype_sens (line 189)<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">      sens = ft_convert_units(sens);<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div><div><p class="MsoNormal">Error in ft_read_sens (line 331)<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">sens = ft_datatype_sens(sens);<u></u><u></u></p></div></div><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div>
<div><p class="MsoNormal"> I had my data in a text format previously, and it didn't work either. So I'm not sure what to do!<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">
I've attached my file in this email, the values are gotten from the pdf info from Easycap regarding the theta/phi coordinates for each site.<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div><div>
<p class="MsoNormal">Thanks!<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">Cheers,<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">Hweeling<u></u><u></u></p></div><div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div></div><div><p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><u></u> <u></u></p><div><p class="MsoNormal">On 22 January 2014 16:00, Herring, J.D. (Jim) <<a href="mailto:j.herring@fcdonders.ru.nl" target="_blank">j.herring@fcdonders.ru.nl</a>> wrote:<u></u><u></u></p>
<div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Hi Hweeling,</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">If you create a text-file that has three columns: Label, Theta, and Phi coordinate, you can use elec = ft_read_sens(filename) to read the layout into a fieldtrip useable elec structure.</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><br>The first line of the text file has to be:</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Site Theta Phi</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">You can also have a look at easycap-M1.txt and easycap-M10.txt in the fieldtrip/template/electrode folder for an example of how the text-file should look like.</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">The theta and phi coordinates will be converted to 3d coordinates assuming a head-radius of 85mm (by default, you can specify this)</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Best,</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">Jim</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> </span><u></u><u></u></p><div style="border:none;border-top:solid #b5c4df 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> <a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl" target="_blank">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a> [mailto:<a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl" target="_blank">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a>] <b>On Behalf Of </b>Hwee Ling Lee<br>
<b>Sent:</b> woensdag 22 januari 2014 15:42<br><b>To:</b> FieldTrip discussion list<br><b>Subject:</b> [FieldTrip] BrainProducts Easycap layout</span><u></u><u></u></p></div><div><div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<div><div><div><p class="MsoNormal">Dear all,<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">I would like to know if anyone has the layout for 128 EEG channels for BrainProduct easycap.<u></u><u></u></p>
</div><div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">I have the information of the theta/phi coordinates for each of the channels, but I'm not sure how to use these values to create the layout in fieldtrip.<u></u><u></u></p>
</div><div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">It'll be great if someone can help me on this!<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">
Thanks.<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">Best regards,<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">Hweeling<u></u><u></u></p></div><div><p class="MsoNormal">
 <u></u><u></u></p></div></div></div></div></div></div></div></div><p class="MsoNormal"><br><br clear="all"><u></u><u></u></p><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div><p class="MsoNormal">-- <u></u><u></u></p><div>
<p class="MsoNormal">=================================================<br>Dr. rer. nat. Lee, Hwee Ling<br>Postdoc<br>German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Bonn<br><br>Email 1: hwee-ling.lee<at><a href="http://dzne.de" target="_blank">dzne.de</a><br>
Email 2: hweeling.lee<at><a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a><u></u><u></u></p><div><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div><div><p class="MsoNormal"><a href="https://sites.google.com/site/hweelinglee/home" target="_blank">https://sites.google.com/site/hweelinglee/home</a><br>
<br>Correspondence Address:<br>Ernst-Robert-Curtius Strasse 12, 53117, Bonn, Germany<br>=================================================<u></u><u></u></p></div></div></div></div></div></div></div><br>_______________________________________________<br>

fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">
=================================================<br>Dr. rer. nat. Lee, Hwee Ling<br>Postdoc<br>German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Bonn<br><br>Email 1: hwee-ling.lee<at><a href="http://dzne.de" target="_blank">dzne.de</a><br>
Email 2: hweeling.lee<at><a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a><div><br></div><div><a href="https://sites.google.com/site/hweelinglee/home" target="_blank">https://sites.google.com/site/hweelinglee/home</a><br>
<br>Correspondence Address:<br>Ernst-Robert-Curtius Strasse 12, 53117, Bonn, Germany<br>=================================================<br></div></div>
</div>