<p dir="ltr">Hi Alexis, </p>
<p dir="ltr">How does your data structure look exactly? I.e. what does matlab display when you type 'data' at the prompt? The error message suggests that it is not yet quite in the appropriate fieldtrip format. </p>

<p dir="ltr">Best, <br>
Eelke </p>
<div class="gmail_quote">Op 29 jul. 2013 17:36 schreef "Alexis" <<a href="mailto:alexis.makin@liverpool.ac.uk">alexis.makin@liverpool.ac.uk</a>> het volgende:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div style="word-wrap:break-word">Hi<div><br></div><div>I already have data which has been cleaned, filtered and artefact rejected etc. </div><div><br></div><div>It is now .mat format (trials X electrodes X time).</div><div>
<br></div><div>I can follow the advice from the wiki below to make a structure which should be compatible with ft_freqanalysis: </div><div><p><font face="'Comic Sans MS'">Alternatively, if you already are able to read the data into Matlab, you
 can reformat that data within Matlab into a datastructure that is 
compatible with FieldTrip. Raw data that is comparable with the output 
of preprocessing should consist of a structure with the fields
</font></p>
<pre><font face="'Comic Sans MS'">data.label   % cell-array containing strings, Nchan X 1
data.fsample % sampling frequency in Hz, single number
data.trial   % cell-array containing a data matrix for each trial (1 X Ntrial), each data matrix is    Nchan X Nsamples 
data.time    % cell-array containing a time axis for each trial (1 X Ntrial), each time axis is a 1 X Nsamples vector 
data.trialinfo % this field is optional, but can be used to store trial-specific information, such as condition numbers, reaction times, correct responses etc. The dimensionality is N x M</font></pre></div><div><br></div>
<div>but when I try to run <font face="'Comic Sans MS'">ft_freqanalysis(cfg, data) </font>on this</div><div><br></div><div>I get the following error messages:</div><div><br></div><div><div><font face="'Comic Sans MS'">??? Error using ==> ft_checkdata at 366</font></div>
<div><font face="'Comic Sans MS'">This function requires raw, comp or mvar data as input.</font></div><div><font face="'Comic Sans MS'"><br></font></div><div><font face="'Comic Sans MS'">Error in ==> ft_freqanalysis at 219</font></div>
<div><font face="'Comic Sans MS'">data = ft_checkdata(data, 'datatype', {'raw', 'comp',</font></div><div><font face="'Comic Sans MS'">'mvar'}, 'feedback', cfg.feedback, 'hassampleinfo', 'yes');</font></div>
<div> </div></div><div>How to I tell the <font face="'Comic Sans MS'">ft_checkdata </font>function what datatype I have? Is this a simple problem?</div><div><br></div><div>Is it common to use fieldtrip functions on data which has already been preprocessed in another way? Or is this not advisable? </div>
<div><br></div><div>cheers,</div><div><br></div><div><br><div>
<div>Alexis</div><div><a href="mailto:alexis.makin@liv.ac.uk" target="_blank">alexis.makin@liv.ac.uk</a></div><div><br></div><div><span style="font-size:13px">Network:</span><span style="font-size:13px"> </span><span style="font-size:13px"><a href="http://www.liv.ac.uk/perception-action/" target="_blank">www.liv.ac.uk/perception-action/</a></span></div>
<div><br></div><br>
</div>
<br></div></div><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div>