<div dir="ltr"><font face="tahoma, sans-serif">Hi,</font><div><font face="tahoma, sans-serif"><br></font></div><div style><font face="tahoma, sans-serif">I am recording from the anesthetized rats using the two NeuroNexus silicone probes with 8 tetrodes (32 channels) each and Neuralynx Cheetah system at 32556 Hz sampling frequency. I choose to analyze the .ncs files from 1/4 of the channels or 1 channel per tetrode. Since the recordings took about 150 mins, the .ncs files are too bulky (0.5 GB) for the standard procedure that the FieldTrip recommends for discontinuous data recorded using Neuralynx system. More precisely, when I preprocess the channels separately and subsequently run the <span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;text-align:justify;white-space:pre-wrap">ft_read_neuralynx_interp on them, I get the "out of memory" error message </span></font><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-family:tahoma,sans-serif;font-size:12px;text-align:justify;white-space:pre-wrap">(even when running it on only two .ncs files at the time).</span></div>
<div style><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;text-align:justify;white-space:pre-wrap"><font face="tahoma, sans-serif"><br></font></span></div><div style="text-align:justify"><font face="tahoma, sans-serif"><font color="#000000"><span style="font-size:12px;white-space:pre-wrap">My question is if I can first downsample all the .csc files that I want to analyze using the ft_spikedownsample, before I run the </span></font><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;white-space:pre-wrap">ft_read_neuralynx_interp on them?</span></font></div>
<div style="text-align:justify"><font face="tahoma, sans-serif"><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;white-space:pre-wrap"><br></span></font></div><div style="text-align:justify">
<br></div><div style="text-align:justify"><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;white-space:pre-wrap"><font face="tahoma, sans-serif"><br></font></span></div><div style="text-align:justify">
<span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;white-space:pre-wrap"><font face="tahoma, sans-serif">Thank you very much,</font></span></div><div style="text-align:justify"><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;white-space:pre-wrap"><font face="tahoma, sans-serif"><br>
</font></span></div><div style="text-align:justify"><span style="background-color:rgb(247,249,250);color:rgb(0,0,0);font-size:12px;white-space:pre-wrap"><font face="tahoma, sans-serif">Ivan</font></span></div><br clear="all">
<div><br></div>-- <br><div>Ivan Skelin, MD, PhD</div>
<div>Postdoctoral Fellow</div>
<div>Polaris Brain Dynamics Research Group</div>
<div>Canadian Centre for Behavioural Neuroscience</div>
<div>The University of Lethbridge</div>
<div>4401 University Dr W</div>
<div>Lethbridge, AB, T1K 3M4</div>
<div>Canada</div>
<div><a href="http://lethbridgebraindynamics.com" target="_blank">http://lethbridgebraindynamics.com</a> </div></div>