<div dir="ltr">Diego,<div><br></div><div>Thank you, that was indeed the problem. I had moved the ft_omri_pipeline script out of the /realtime/online_mri directory, which caused the problems.</div><div><br></div><div style>
Thanks,</div><div style>Andrew</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jun 5, 2013 at 9:39 AM, Lozano Soldevilla, D. (Diego) <span dir="ltr"><<a href="mailto:d.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl" target="_blank">d.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:12pt;font-family:Times New Roman">Hi Andrew,<br><br>Could you please check inside your matlab path there's the realtime/mri directory where ft_omri_pipeline_nuisance.m function is located?<br>
<br>Mine looks like this:<br> <br>'/home/electromag/dieloz/matlab/<strong>fieldtrip-dev/realtime/online_mri/</strong>'<br><br>If it's there, you shouldn't have the private folder problem. Otherwise, add from the command window and tell me.<br>
<br>best,<br><br>Diego<br><br><hr><blockquote style="border-left:2px solid rgb(16,16,255);margin-left:5px;padding-left:5px"><b>From: </b>"Andrew Brooks" <<a href="mailto:andmib@gmail.com" target="_blank">andmib@gmail.com</a>><br>
<b>To: </b>"Diego Lozano" <<a href="mailto:diego.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl" target="_blank">diego.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl</a>>, "FieldTrip discussion list" <<a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@science.ru.nl</a>><br>
<b>Sent: </b>Tuesday, 4 June, 2013 5:01:43 PM<br><b>Subject: </b>Re: [FieldTrip] Private function problems<div><div class="h5"><br><br><div dir="ltr">Hello Diego,<div><br></div><div>I am using the example pipeline script from an earlier version of FieldTrip (ft_omri_pipeline_nuisance). The exact code that is throwing the error: curSixDof = hom2six(M).</div>

<div><br></div><div>I did run the three lines of code to reset the default paths, add fieldtrip, and then ran ft_defaults. The version of FieldTrip I am using is 20130602.</div><div><br></div><div>
Thanks,</div><div>Andrew</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jun 3, 2013 at 4:53 PM, Lozano Soldevilla, D. (Diego) <span dir="ltr"><<a href="mailto:d.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl" target="_blank">d.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:12pt;font-family:Times New Roman">Hi Andrew,<div><br></div><div>Did you type the following?</div>

<div><br></div><div>>> restoredefaultpath</div><div>>> addpath /fieldtripxxxx</div><div>>> ft_defaults<br><br>What's the ft_* function you invoke to get the error 'undefined function 'hom2six'? And what's the fieldtrip version you're using?</div>

<div><br></div><div>best,</div><div><br></div><div>Diego <br><br><hr><blockquote style="border-left:2px solid rgb(16,16,255);margin-left:5px;padding-left:5px"><b>From: </b>"Andrew Brooks" <<a href="mailto:andmib@gmail.com" target="_blank">andmib@gmail.com</a>><br>

<b>To: </b>"FieldTrip discussion list" <<a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@science.ru.nl</a>><br><b>Sent: </b>Monday, 3 June, 2013 10:15:49 PM<br><b>Subject: </b>[FieldTrip] Private function problems<div>

<div><br><br><div dir="ltr"><div><div>Hello all,<br><br></div>I followed the instructions on properly adding FieldTrip to the Matlab path file. However, I continue to run into errors involving private functions. In this case, I get the error 'undefined function 'hom2six' for input arguments of type 'double''.<br>


<br>Does anybody have a suggestion as to why this is occurring?<br><br></div>Thanks!<br>Andrew<br></div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>fieldtrip mailing list<br><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br><a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></blockquote>

<br><br><br>-- <br><div><span></span>PhD Student<br>Neuronal Oscillations Group<br>Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour <br>Centre for Cognitive Neuroimaging<br>Trigon, room 0.83<br>Kapittelweg 29<br>
Radboud University Nijmegen <br>NL-6525 EN Nijmegen<br>The Netherlands<br>E-Mail: <a href="mailto:d.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl" target="_blank">d.lozanosoldevilla@fcdonders.ru.nl</a><br>Tel:     +31-(0)24-36-66274<br>

Web:   <a href="http://www.neuosc.com/" target="_blank">http://www.neuosc.com/</a> <span></span><br></div></div></div></div><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>fieldtrip mailing list<br><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br><a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></div>
</div></blockquote></div></div><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>