<div dir="ltr"><div style>Dear all,</div><div style><br></div><div style><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:14px">Hello, my name is BJ Min from Korea.</span><br></div><div style><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:14px"><br>
</span></div><div>I'm dealing with EEG data of many subjects. </div><div><br></div><div>When I run ft_preprocessing, the error message below shows with only some files of my data. (not all files)</div><div><br></div><div>
Warning: rounding "endsample" to the nearest integer </div><div>> In ft_read_data at 100</div><div>  In ft_preprocessing at 577</div><div>??? Error using ==> ft_read_data at 149</div><div>cannot read data after the end of the file</div>
<div><br></div><div>Error in ==> ft_preprocessing at 577</div><div>      dat = ft_read_data(cfg.datafile, 'header', hdr, 'begsample', begsample, 'endsample', endsample, 'chanindx', rawindx,</div>
<div>      'checkboundary', strcmp(cfg.continuous, 'no'), 'dataformat', cfg.dataformat) </div><div><br></div><div>I think that there might be a kind of problem in data acquisition, and I modified below scripts in the ft_read_data function with comment %.</div>
<div><br></div><div>% % test whether the requested data segment is not outside the file</div><div>% if any(begsample<1)</div><div>%   error('FILEIO:InvalidBegSample', 'cannot read data before the begin of the file');</div>
<div>% elseif any(endsample>(hdr.nSamples*hdr.nTrials))</div><div>%   error('FILEIO:InvalidEndSample', 'cannot read data after the end of the file');</div><div>% end</div><div><br></div><div>After that, the ft_preprocessing worked well.</div>
<div><br></div><div>However, the files with the first problem showed additional warning message while running ft_definetrial. (not error message)</div><div><br></div><div>Warning: Integer operands are required for colon operator when used as index </div>
<div>> In fileio\private\loadcnt at 464</div><div>  In ft_read_header at 1450</div><div>  In ft_preprocessing at 398</div><div><br></div><div>Warning: rounding "endsample" to the nearest integer </div><div>> In ft_read_data at 100</div>
<div>  In ft_preprocessing at 577</div><div><br></div><div>Also, during ft_redefinetrial, following warning message occurs.(not error message)</div><div><br></div><div>Warning: removing inconsistent sampleinfo </div><div>
> In ft_datatype_raw at 97</div><div>  In ft_checkdata at 213</div><div>  In ft_redefinetrial at 104</div><div><br></div><div>Warning: the trial definition in the configuration is inconsistent with the actual data </div>
<div>> In utilities\private\warning_once at 116</div><div>  In utilities\private\fixsampleinfo at 74</div><div>  In ft_datatype_raw at 154</div><div>  In ft_checkdata at 213</div><div>  In ft_redefinetrial at 206</div>
<div><br></div><div>Warning: reconstructing sampleinfo by assuming that the trials are consecutive segments of a continuous recording </div><div>> In utilities\private\warning_once at 116</div><div>  In utilities\private\fixsampleinfo at 79</div>
<div>  In ft_datatype_raw at 154</div><div>  In ft_checkdata at 213</div><div>  In ft_redefinetrial at 206</div><div><br></div><div>I wonder if these messages during ft_redefinetrial mean wrong defining trials. </div><div>
Should I continue these process like this, modifying the ft_preprocessing function? </div><div>Or, is it better to exclude some erroneous files?</div><div><br></div><div>Best regards</div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">
<div><font face="arial, helvetica, sans-serif">BeomJun Min, M.D.</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px">Department of Medical System Engineering (DMSE)<br>
</span><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px">Gwangju Institute of Science and Technology (GIST)</span><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px"> </span><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px"><br>
261 Cheomdan-gwagiro(Oryong-dong), Buk-gu, Gwangju <br>500-712, Republic of Korea (South) <br>Phone: +82-62-715-3266 / Fax: +82-62-715-3244 <br>E-mail: </span><a href="mailto:mbj0310@gmail.com" style="text-decoration:none;line-height:18px" target="_blank"><span>mbj0310@gmail.com</span></a><span style="color:rgb(51,51,51);line-height:18px">, <a href="http://bmssa.gist.ac.kr/" style="text-decoration:none" target="_blank">http://bmssa.gist.ac.kr</a></span></font><br>
</div></div>
</div>