<div dir="ltr"><div>Hi, Kathrin,</div><div><br></div><div>I meet similar question on comparison of ERP between two group subjects using ft_timelockstatistics and  ft_timelockanalysis. One group has 12 subjects, another group has 43 subjects, and my design matrix is like</div>
<div><br></div><div>design = zeros(1, 55);</div><div>design(1, 1:12) = 1;</div><div>design(1, 12+1:end )= 2;</div><div>cfg.design = design;             % design matrix</div><div>cfg.ivar  = 1;      </div><div><br></div><div>
<br></div><div>After I invoke ft_timelockanalysis, I use ft_timelockgrandaverage to calculate grand average with cfg.keepindividual = 'yes' . Then the following ft_timelockstatistics  works well. If I use cfg.keepindividual = 'no' in ft_timelockgrandaverage , the ft_timelockstatistics has error 'the size of the design matrix does not match the number of observations in the data'  in its statistics_wrapper subfunction.  </div>
<div><br></div><div>My question is why I should keep all trials data (cfg.keepindividual = 'yes') in ft_timelockgrandaverage ? I guess the method in ft_timelockstatistics should use subjects averaged data as sample ( average over trials data of this subject ) not use all subjects trial-based data. Am I correct?</div>
<div><br></div><div>Thanks for your help.</div><div><br></div><div>ke</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Sat, Dec 1, 2012 at 9:15 AM, Kathrin Müsch <span dir="ltr"><<a href="mailto:k.muesch@uke.uni-hamburg.de" target="_blank">k.muesch@uke.uni-hamburg.de</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Nenad,<br>
<br>
It's like a between trials experiment within one subject (first example of the tutorial). Your design is correct. Remember to use independent samples statistics because you compare two independent groups (in your case subjects).<br>

<br>
cfg.statistic = 'indepsamplesT';<br>
cfg. design = design;<br>
cfg.ivar = 1;<br>
<br>
Best,<br>
Kathrin<br>
<br>
Am 01.12.2012 um 15:02 schrieb Nenad Polomac:<br>
<div><div class="h5"><br>
> Hi everybody,<br>
><br>
> I have some doubts concerning statistic in between subjects experiment. I couldn't find explanation for this case in tutorial.<br>
> I have two groups of subjects. And I would like to compare this two groups for the same condition using ft_freqstatistics (cfg.correctm = 'cluster'). I have two time frequency grand average for each group (8 subjects in each group; cfg.keepindividual = 'yes';). I am not sure how a design matrix for ft_freqstatistics suppose to look like<br>

><br>
> I suppose: design=[1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2]<br>
> Is this correct?<br>
><br>
> Thank you in advance!<br>
><br>
> Nenad<br>
><br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> fieldtrip mailing list<br>
> <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
> <a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<br>
<br><p><br>
--<br>
Pflichtangaben gemäß Gesetz über elektronische Handelsregister und Genossenschaftsregister sowie das Unternehmensregister (EHUG):</p>

<p>Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf; Körperschaft des öffentlichen Rechts; Gerichtsstand: Hamburg</p>

<p>Vorstandsmitglieder: Prof. Dr. Martin Zeitz (Vorsitzender), Dr. Alexander Kirstein, Joachim Prölß, Prof. Dr. Dr. Uwe Koch-Gromus </p><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>