<div dir="ltr">Dear Frank,<div><br></div><div>You're on the right way of thinking.   I think the answer partially depends on your hypothesis.  In the tutorial situation of a Post and Pre, there is the hypothesis that nothing of interest is going on in Pre, and that the experimental manipulation is causing something to occur in Post, and the researcher is asking how Post differs from Pre.</div>


<div><br></div><div>In your case of Left and Right, if you are assuming that these are equally interesting experimental manipulations (i.e. neither is the 'baseline' condition), then often the denominator is formed by the average of the two conditions:</div>

<div>
<br></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">sourceDiff = sourceLeft_con;  % or sourceRight_con, does not matter</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">


<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">sourceDiff.avg.pow = (sourceLeft_con.avg.pow - sourceRight_con.avg.pow) ./ </span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">(0.5* sourceLeft_con.avg.pow +0.5* sourceRight_con.avg.pow);</span><br>


</div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px"><br></span></div><div style><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">Cheers,<br>Johanna</span></div><div>

<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px"><br></span></div><div>
<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2013/2/7 Frank Mei <span dir="ltr"><<a href="mailto:frank.ye.mei@gmail.com" target="_blank">frank.ye.mei@gmail.com</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Hi All,<br><br>The tutorial here (<a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/tutorial/beamformer" target="_blank">http://fieldtrip.fcdonders.nl/tutorial/beamformer</a>) provides example of activity contrasted with baseline, but not activity of condition 1 contrasted with condition 2.<br>


<br>Could someone kindly give some example code that contrasts two activities, for example left vs right button pressing?<br><br>I am thinking about modifying the example code in the tutorial, by turn the code<br>-------<br>


sourceDiff = sourcePost_con;
<br>sourceDiff.avg.pow = (sourcePost_con.avg.pow - sourcePre_con.avg.pow) ./ sourcePre_con.avg.pow;<br>--------<br>into A:<br>--------<br>sourceDiff = sourceLeft_con;<br> sourceDiff.avg.pow = (sourceLeft_con.avg.pow - sourceRight_con.avg.pow) ./ sourceRight_con.avg.pow;<br>


--------<br><br>or into B:<br>--------<br>sourceDiff = sourceRight_con;<br> sourceDiff.avg.pow = (sourceRight_con.avg.pow - sourceLeft_con.avg.pow) ./ sourceLeft_con.avg.pow;<br>--------<br><br>Not sure if I should use "A" or "B", or something else.<br>


<br>thanks,<br>Frank<br>
<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>