<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">One typically gets the complex numbers from ICA when the data have less than full rank.  For example, if there is a channel that is a flat line (maybe a bad channel or a reference) or when two channels are perfectly correlated (as when the data is mean mastoid referenced and one has included both mastoid channels as they will have a perfect -1 correlation).<div><br></div><div>Cheers!</div><div><br></div><div>Joe<br><div><br></div><div><br></div><div><br><div><div>On Oct 5, 2012, at 12:30 PM, Valentina Niccolai <<a href="mailto:vale.niccolai@gmail.com">vale.niccolai@gmail.com</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><p class="MsoNormal">Hallo.</p><p class="MsoNormal">I have a problem with the ICA, which I did not have before
with the same dataset. It seems not to work properly because it gives complex
numbers. The problem occurs also if I use older ft versions. I give in the ICA
the output of ft_rejectvisual (already preprocessed data), which looks normal
to me.</p><p class="MsoNormal">Here below is the output of ft_componentanalysis and in
attachment the strange output when calling ft_databrowser: some or all the
components are “dead” and the head views as well as the component number on the
top disappear.</p><p class="MsoNormal">I am thankful for any help.</p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><p class="MsoNormal">Valentina Niccolai</p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><p class="MsoNormal">   
cfg.method       = 'runica';    </p><p class="MsoNormal">    cfg.channel     
= {'all','-EOG','-EMG'};</p><p class="MsoNormal">    comp = ft_componentanalysis(cfg,
rej_vis_res); </p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><p class="MsoNormal">The result of my component analysis looks like this:</p><p class="MsoNormal">comp = </p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><p class="MsoNormal">      fsample: 600</p><p class="MsoNormal">         time:
{1x237 cell}</p><p class="MsoNormal">        trial: {1x237
cell}</p><p class="MsoNormal">         topo:
[306x2 double]</p><p class="MsoNormal">     unmixing: [2x306 double]</p><p class="MsoNormal">        label: {2x1 cell}</p><p class="MsoNormal">    topolabel: {306x1 cell}</p><p class="MsoNormal">         grad: [1x1
struct]</p><p class="MsoNormal">    trialinfo: [237x1 double]</p><p class="MsoNormal">          cfg:
[1x1 struct]</p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><p class="MsoNormal">and in comp.trial I get imaginary numbers:</p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div><p class="MsoNormal">>> comp.trial{1}</p><p class="MsoNormal">ans =</p><p class="MsoNormal">   1.0e-18 *</p><p class="MsoNormal">  Columns 1 through 6</p><p class="MsoNormal">   0.0127 - 0.0000i  -0.0339 + 0.0000i 
-0.0203 + 0.0000i  -0.0269 - 0.0000i   0.0176 + 0.0000i 
-0.0538 + 0.0000i</p><p class="MsoNormal">  -0.0069 - 0.0000i   0.0075 -
0.0000i   0.0097 - 0.0000i   0.0033 - 0.0000i  
0.0214 - 0.0001i  -0.0031 - 0.0001i</p><div> <br class="webkit-block-placeholder"></div>

<span><ica.jpg></span>_______________________________________________<br>fieldtrip mailing list<br><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</blockquote></div><br><div apple-content-edited="true">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Courier; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div><div><br>--------------------------------------------------------------------------------</div><div><br></div><div>Joseph Dien,</div><div>Senior Research Scientist</div><div>University of Maryland </div><div><br></div><div>E-mail: <a href="mailto:jdien07@mac.com">jdien07@mac.com</a></div><div>Phone: 301-226-8848</div><div>Fax: 301-226-8811</div><div><a href="http://joedien.com//">http://joedien.com//</a></div></div><br></div><div><br></div><div><br></div><br></div></span></div></span></div></span></div></span></div></span></div></span></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></span><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br></div></div></body></html>