Hi Jinghao,<div><br></div><div>I forwarded your question to the Fieldtrip mailing list. I don't entirely understand what you mean only saving clusters with psychological meaning. Given the parameters that you chose, you get a certain number of clusters, all of which are significant as a whole. In analogy, this means that the whole 'mountain range' is significant or not, not the 'individual peaks'. You could of course focus on a few of those clusters in your report, as long as you mention the other clusters. You could also try to set your parameters a little more stringent (i.e. a lower cfg.clusteralpha), this would 'reduce the number of peaks in your mountain range', as some peaks would then fall below the threshold. Hopefully, your clusters with 'psychological meaning' would still show up, albeit a little smaller/shorter.</div>

<div><br></div><div>Hope this helps,</div><div>Roemer</div><div><br></div><div><br><br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
Well in fact I'm doing an intracranial EEG project currently where the data<br>
should be analyzed statistically. The permutation analysis seems a good<br>
choice and first I ran it with sample-specific independent t-test to get a<br>
rough idea of the data in different conditions.<br>
<br>
I'm wondering how to apply cluster-based permutation in single sensor<br>
analysis where I would like to save only the time clusters with<br>
psychological meaning. I could not find the guidance of how to do this in<br>
Fieldtrip. Could you please share with me the approach? That'll be really<br>
helpful.<br>
<br>
Best Regards,<br>
Jinghao Lu<br>
<br>
<br>
Dept. of Physics<br>
Zhejiang University<br>
866 Yuhangtang Road<br>
Hangzhou<br>
310058 ZHEJIANG<br>
CHINA<br>
<br>
Temporary Affiliate<br>
Dynamic Memory Lab<br>
UC Davis<br>
<br>
<br>
Jinghao Lu<br>
<br>
<br>
Dept. of Physics<br>
Zhejiang University<br>
866 Yuhangtang Road<br>
Hangzhou<br>
310058 ZHEJIANG<br>
CHINA<br>
<br>
Temporary Affiliate<br>
Dynamic Memory Lab<br>
UC Davis<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><font size="3"><font color="darkblue"><font face="calibri">Roemer
            van der Meij M.Sc.<br>
            PhD student<br>
            Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour<br>
            Centre for Cognition<br>
            P.O. Box 9104<br>
            6500 HE Nijmegen<br>
            The Netherlands<br>
            Tel: +31(0)24 3655932<br>
            E-mail: <a href="mailto:r.vandermeij@donders.ru.nl" target="_blank">r.vandermeij@donders.ru.nl</a></font></font></font><div style="padding:0px;margin-left:0px;margin-top:0px;overflow:hidden;word-wrap:break-word;color:black;font-size:10px;text-align:left;line-height:130%">

</div><br>
</div>