Dear Stephen,<div><br></div><div>Thanks for the suggestion. I have already one function that is doing all the preprocessing and saving as well. But this seams not to solve the issue.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>

Eliana</div><div><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 10, 2012 at 6:01 PM, Stephen Whitmarsh <span dir="ltr"><<a href="mailto:stephen.whitmarsh@gmail.com" target="_blank">stephen.whitmarsh@gmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Eliana,<div><br></div><div>You could try creating a function that does all this preprocessing and then writes the output to file.</div>

<div>If you then call this function in a (subject) loop you are sure that Matlab will free up the memory it used for that function. </div>
<div><br></div><div>Perhaps it helps,</div><div><br></div><div>Stephen</div><div><br><div class="gmail_quote"><div><div class="h5">On 10 July 2012 16:57, Eliana Garcia <span dir="ltr"><<a href="mailto:elilife@gmail.com" target="_blank">elilife@gmail.com</a>></span> wrote:<br>


</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5">Hello Dear Fieldtrip Community,<div><br></div><div>I am having now problems with processing my data. I am analyzing a quite big data set with 400 trials that are composed by 10 sec (re-sampled at 150Hz). I am doing first a demean, then planar gradient transformation, time-frequency analysis using multitapers and then combine the planar gradient again. For the first subject always runs normally, but for the second one matlab gets really slow. I am taking care in deleting the variables that I create with big amount of data after I don't need them any more, so I am using just one big file that is being safe at the end (average time-frequency across trials) for each of the subjects. Every time matlab starts to analyze a new subject I am using clear all (with exceptions like directory and name of subject) but stills with every new subject it gets slower and slower.</div>




<div><br></div><div>Do you have any advises to make the analysis faster? Sometimes is too slow and the computer normally crashes after 3 subjects.</div><div><br></div><div>Thank you very much for the attention.</div><div>




<br></div><div>Best,<span><font color="#888888"><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;border-collapse:collapse;color:rgb(136,136,136)"><div>
Eliana García Cossio<br>Applied Neurotechnology Lab.<br>

</div><div>Graduate School of Neural and Behavioural Science - Max Planck Research School<br>Institute of Medical Psychology and Behavioural Neurobiology<br>Universität Tübingen</div><div>(+0049) 01 577-8587604 <br><span lang="EN-US">Otfried-Müller-Str. 47</span><span lang="EN-US"></span><span lang="EN-US">, 72076 <br>




</span>Tübingen- Germany</div></span></div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;border-collapse:collapse;color:rgb(136,136,136)"></span></div><br>
</font></span></div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;border-collapse:collapse;color:rgb(136,136,136)"><div>

Eliana García Cossio<br>Applied Neurotechnology Lab.<br></div><div>Graduate School of Neural and Behavioural Science - Max Planck Research School<br>Institute of Medical Psychology and Behavioural Neurobiology<br>Universität Tübingen</div>

<div>(+0049) 01 577-8587604 <br><span lang="EN-US">Otfried-Müller-Str. 47</span><span lang="EN-US"></span><span lang="EN-US">, 72076 <br></span>Tübingen- Germany</div></span></div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;border-collapse:collapse;color:rgb(136,136,136)"></span></div>

<br>
</div>