I have the same Problem. I can plot my LCMV-Beamformer results on an anatomy. And I can plot the results of the normalize script. But I can't plot the GrandAVG or the Stats results on that anatomy. The interpolate function doesn' work. Without anatomy it works just fine.<div>
<br></div><div>Any hint?</div><div><br></div><div>Thanks, Martin<br><br><div class="gmail_quote">On Sat, Jun 23, 2012 at 8:19 AM, jan-mathijs schoffelen <span dir="ltr"><<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" target="_blank">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hi Cornelius,<div><br></div><div>Could it be that the parameter 'avg.avg.pow' does not work?</div>
<div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>JM</div><div><div><div class="h5"><br><div><div>On Jun 22, 2012, at 2:38 PM, cornelius abel wrote:</div><br><blockquote type="cite"><div>Dear Fieldtrip list,<br><br>i successfully beamformed some steady state activity and the sourceplots per subject are looking very nice.<br>
As a next step I tried to calculate a grand average using ft_sourcegrandaverage:<br><br>cfg=[];<br>cfg.keepindividual='no';<br>cfg.parameter='avg.pow';<br>GACont= ft_sourcegrandaverage(cfg, AllsourceCont{:});<br>
<br>giving me the following structure:<br><br>GACont =<br>pos: [3570x3 double]<br>dim: [17 14 15]<br>avg: [1x1 struct]<br>var: [1x1 struct]<br>dimord: 'voxel'<br>inside: [1846x1 double]<br>outside: [1724x1 double]<br>
df: [3570x1 double]<br>cfg: [1x1 struct]<br><br>but interpolating this onto an anatomy always gives me an error:<br><br>cfg = [];<br>cfg.downsample= 2;<br>cfg.parameter = 'avg.avg.pow';<br>sourceDiffInt= ft_sourceinterpolate(cfg, GACont , mri);<br>
<br>/??? Error using ==> interpn at 155/<br>///Wrong number of input arguments or some dimension of V is less than 2./<br>///Error in ==> ft_sourceinterpolate>my_interpn at 464/<br>///av(sel) = interpn(fv, ax(sel), ay(sel), az(sel), interpmethod);/<br>
///Error in ==> ft_sourceinterpolate at 368/<br>///av( sel) = my_interpn(fv, ax(sel), ay(sel), az(sel), cfg.interpmethod, cfg.feedback);/<br><br>however interpolating a single subject source data works just fine...<br>
<br>cfg = [];<br>cfg.downsample= 2;<br>cfg.parameter = 'avg.pow';<br>sourceDiffInt= ft_sourceinterpolate(cfg, AllsourceCont{1} , mri);<br><br><br>What am i doing wrong here, any ideas?<br><br><br><br>Greetings, Cornelius<br>
<br>_______________________________________________<br>fieldtrip mailing list<br><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br><a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</div></blockquote></div><br></div></div><div>
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;text-align:-webkit-auto;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;text-align:-webkit-auto;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="word-wrap:break-word">
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;text-align:-webkit-auto;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="word-wrap:break-word">
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="word-wrap:break-word">
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="word-wrap:break-word">
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="word-wrap:break-word">
<div>Jan-Mathijs Schoffelen, MD PhD </div><div><br></div><div>Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour, <br>Centre for Cognitive Neuroimaging,<br>Radboud University Nijmegen, The Netherlands</div><div><br></div>
<div>Max Planck Institute for Psycholinguistics,</div><div>Nijmegen, The Netherlands</div><div><br></div><div><a href="mailto:J.Schoffelen@donders.ru.nl" target="_blank">J.Schoffelen@donders.ru.nl</a></div><div>Telephone: <a href="tel:%2B31-24-3614793" value="+31243614793" target="_blank">+31-24-3614793</a></div>
</div></span></div></span></div></span></div></span></div></span></span>
</div>
<br></div></div><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>