Hi everyone,<div><br></div><div>I'm considering the possibility to append the MEG data (CTF-275) from 3 different runs (recorded within the same day but with different headpositions in the dewar) into one single dataset. That is, combine my datasets in the sensor-space.</div>

<div>I've been reading about the possibility to use the ft_megrealign function in order reconstruct the magnetic fields onto a standard gradiometer location,</div><div>However, in the literature this is mainly used to average data across subjects rather than across runs.</div>

<div><br></div><div>I did a test using the following code:</div><div><i>cfg= [];</i></div><div><div><i>cfg.template{1} = run1.grad;</i></div><div><i>cfg.template{2} = run2.grad;</i></div><div><i>cfg.template{3} = run3.grad;</i></div>

<div><i><br></i></div><div><i>cfg.vol = vol;   %  single shell headmodel computed from individual MRI</i></div><div><i>cfg.inwardshift = 3;</i></div><div><i>cfg.verify = 'yes';</i></div><div><i>cfg.feedback = 'yes';</i></div>

<div><i>[interp1] = ft_megrealign(cfg, run1);  % trial-based data</i></div></div><div><div><i>[interp1] = ft_megrealign(cfg, run1);</i></div><div>[interp1] = ft_megrealign(cfg, run1);</div><br class="Apple-interchange-newline">

</div><div>acording to the results (I show the highest RV), the difference between the original and the realigned data seem really small (which I assume it's good)</div><div><div><i>original -> template             RV 2.22 %</i></div>

<div><i>original             -> original RV 2.11 %</i></div><div><i>original -> template -> original RV 2.14 %</i></div></div><div><br></div><div><br></div><div>I'm wondering whether anyone has experience in using ft_megrealign across runs/sessions and can recommend it (any advise is welcomed).<br>

</div><div>According to Knosche (2002), the method seems good but I'd like to know whether someone has test it in real-life situations (especially taking into account the head position differences in the z axis)</div>

<div><br></div><div>Can affect the accuracy of the subsequent source reconstruction?</div><div><br></div><div><div><br></div>-- <br>Marc Recasens</div><div>PhD Student<br>Universitat de Barcelona<br>Tel.: +34 639 24 15 98<br>

<br>
</div>