<div dir="ltr">Got it. Awesome :)<div><br></div><div>Thanks!<br><br><div class="gmail_quote">On 11 May 2012 10:43, Stephen Whitmarsh <span dir="ltr"><<a href="mailto:stephen.whitmarsh@gmail.com" target="_blank">stephen.whitmarsh@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Roni & Steve,<br>
<br>
Thank you for reminding me one can compare datastructures containing<br>
means computed by ft_timelockgrandaverage. I forgot about that. Then<br>
indeed the mean/var has to be re-computed every time if you are trying<br>
out different subject to reject (and the designmatrix has to stay the<br>
same). Ofcourse you are rejecting subjects based on a-priori criteria,<br>
not on the effect it has on the results, so you shouldn't have to do<br>
it too often ;-)<br>
<br>
However, to explain what I meant previously: you do not have to<br>
compute a grandaverage first, and then do statistics. You can put<br>
those subjects (of both groups) straight into ft_timelockstatistics,<br>
and use the designmatrix to specify group membership with 1's and 2's.<br>
Using a 0 instead for one of your subjects would exclude that subject<br>
from the analysis.<br>
(see <a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/walkthrough#non-paired_comparison" target="_blank">http://fieldtrip.fcdonders.nl/walkthrough#non-paired_comparison</a>).<br>
<br>
Have a nice day!<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Stephen<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
<br>
<br>
On 10 May 2012 20:55, Roni Tibon <<a href="mailto:ronitibon@gmail.com">ronitibon@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Dear Stephen and Steve,<br>
><br>
> Thank you for your answers.<br>
><br>
> Stephen, if I understand you correctly, option 1 means I have to compute the<br>
> grand average again (using ft_timelockgrandaverage), which is what I tried<br>
> to avoid.<br>
><br>
> I tried option 2 though, and it didn't work.<br>
> When I used a zero entry at the uvar line, the data stayed exactly the same<br>
> (as if the subject was not excluded). When I used a zero entry at the ivar<br>
> line (or at both lines), i get an error message saying "invalid<br>
> specification for the design array".<br>
><br>
> I also tried skipping the entry all together, but got an error message<br>
> saying "the size of the design matrix does not match the number of<br>
> observations in the data"<br>
><br>
> An I doing something wrong?<br>
><br>
> Steve, I guess I can do that.. the reason I'm asking is cause I want to<br>
> "play" with the data a bit - remove a different subjects each time and see<br>
> if I still get the same pattern. So I thought it would be easier if I did<br>
> not have to compute the grand average again and again.<br>
><br>
> Thanks!<br>
> Roni<br>
><br>
> On 10 May 2012 14:07, Stephen Whitmarsh <<a href="mailto:stephen.whitmarsh@gmail.com">stephen.whitmarsh@gmail.com</a>> wrote:<br>
>><br>
>> Hi Tony,<br>
>><br>
>> Thanks for your question.<br>
>><br>
>> First of all, I do not fully understand what you mean with 'without<br>
>> computing the averages again', but I'll have a shot at it.<br>
>><br>
>> In ft_freq/timelock-statistics you enter all your 'units of<br>
>> observations', i.e. data structures per subject or condition that you<br>
>> want to compare, together with the design matrix. The designmatrix is<br>
>> a one or two row matrix with as many columns as your have<br>
>> data-entries. One of the rows codes the group/condition membership of<br>
>> those entries (the independent variable). They can be subjects (group<br>
>> analysis) or trials (within-subjects analysis). Another row might be<br>
>> used to code the observation number in case you are doing a paired<br>
>> test.<br>
>><br>
>> To exclude one data entry (i.e. subject) for your<br>
>> ft_timelockstatistics you could either:<br>
>> 1) not enter that datastructure as data in ft_freqstatistics, and also<br>
>> remove it from your design matrix.<br>
>> 2) keep your input to ft_timelockstatistics the same but use a zero<br>
>> for that entry in you design matrix. In this case that data input will<br>
>> not be used to calculate your statistics.<br>
>><br>
>> I would say the second option is more elegant, but it is more prone to<br>
>> mistakes perhaps. You would do me a favour if you would doublecheck<br>
>> that it gives you the same results as option 1.<br>
>><br>
>> I hope this answers your question,<br>
>><br>
>> Stephen<br>
>><br>
>><br>
>><br>
>> On 10 May 2012 12:09, Roni Tibon <<a href="mailto:ronitibon@gmail.com">ronitibon@gmail.com</a>> wrote:<br>
>> > Hi all,<br>
>> > Is there an elegant way to exclude a subject from the statistical<br>
>> > analysis<br>
>> > when using ft_timelockstatistics, without computing the averages again<br>
>> > while<br>
>> > excluding the subject?<br>
>> ><br>
>> > Thanks!<br>
>> > Roni<br>
>> ><br>
>> > --<br>
>> >    /\.../\<br>
>> >   ( -- ---)__{}<br>
>> >    (_.._...._)<br>
>> ><br>
>> > <a href="http://shkafkafim.blogspot.com/" target="_blank">http://shkafkafim.blogspot.com/</a><br>
>> ><br>
>> ><br>
>> > _______________________________________________<br>
>> > fieldtrip mailing list<br>
>> > <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
>> > <a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
>><br>
>> _______________________________________________<br>
>> fieldtrip mailing list<br>
>> <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
>> <a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
>    /\.../\<br>
>   ( -- ---)__{}<br>
>    (_.._...._)<br>
><br>
> <a href="http://shkafkafim.blogspot.com/" target="_blank">http://shkafkafim.blogspot.com/</a><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> fieldtrip mailing list<br>
> <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
> <a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">   /\.../\<br>  ( -- ---)__{}<br>   (_.._...._)<br><br><a href="http://shkafkafim.blogspot.com/" target="_blank">http://shkafkafim.blogspot.com/</a><br>
</div><br>
</div></div>