
<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Alex,<div><div><br><blockquote type="cite"><div>it does yes. My question is then how do you compute the withering matrix?<br></div></blockquote><div><br></div><div>That's the magic of EEGlab ;-). I did not look into the code but I would assume based on the estimate of the precision matrix. Do you think the magnitude problem will lead to numerical issues upon inversion of the covariance matrix?</div><br><blockquote type="cite"><div><blockquote type="cite">Also can Fieldtrip write data back into fif files keeping intact<br></blockquote><blockquote type="cite">all the measurement info?<br></blockquote><blockquote type="cite"><br></blockquote><blockquote type="cite">Not really; I have some code of Lauri's (which is not yet in FT), which can<br></blockquote><blockquote type="cite">write epoched data to a fif-file. However, most of the measurement info is<br></blockquote><blockquote type="cite">lost along the way.<br></blockquote><br>that's what I feared.<br><br><blockquote type="cite">Also, since we're not fif-experts, it's not trivial for<br></blockquote><blockquote type="cite">us to find out how the measurement info should be formatted. Of course it is<br></blockquote><blockquote type="cite">possible to reverse engineer this from the mne-code, but this is heavily<br></blockquote><blockquote type="cite">geared towards elekta hardware. Yet, I could imagine that this functionality<br></blockquote><blockquote type="cite">could be valuable, because it would enable two-way traffic of data between<br></blockquote><blockquote type="cite">FT and MNE-suite.<br></blockquote><br>that would be very valuable indeed.<br><br><blockquote type="cite">Do you happen to have any code that writes meaningful<br></blockquote><blockquote type="cite">measurement info?<br></blockquote><br>not in one function or at least not in matlab.<br><br>one should have a fiff_write_meas_info.m that does the opposite to:<br><br><a href="https://github.com/mne-tools/mne-matlab/blob/master/matlab/fiff_read_meas_info.m">https://github.com/mne-tools/mne-matlab/blob/master/matlab/fiff_read_meas_info.m</a><br><br>part of the answer is in:<br><br>https://github.com/mne-tools/mne-matlab/blob/master/matlab/fiff_write_evoked.m<br><br>a python example is in :<br><br>https://github.com/mne-tools/mne-python/blob/master/mne/fiff/meas_info.py#L235<br><br>but I agree you need a fairly good understanding of the fif format…<br><br>we might have to sit down together to do this.<br></div></blockquote><div><br></div><div>I am afraid so. Well, I would certainly be up for it, because it would further strengthen both packages. Shall I come to you, or will you come to me ;-)?</div><div><br></div><div>JM</div><div><br></div><div><br></div><br><blockquote type="cite"><div>Alex<br><br>_______________________________________________<br>fieldtrip mailing list<br><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip<br></div></blockquote></div><br><div>

<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Jan-Mathijs Schoffelen, MD PhD </div><div><br></div><div>Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour, <br>Centre for Cognitive Neuroimaging,<br>Radboud University Nijmegen, The Netherlands</div><div><br></div><div>Max Planck Institute for Psycholinguistics,</div><div>Nijmegen, The Netherlands</div><div><br></div><div><a href="mailto:J.Schoffelen@donders.ru.nl">J.Schoffelen@donders.ru.nl</a></div><div>Telephone: +31-24-3614793</div></div></span></div></span></div></span></div></span></div></span></span>

</div>

<br></div></body></html>