Hi Candida,<br><br>Welcome to FieldTrip. It seems you can import Neuromag data directly into FieldTrip: see <a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/getting_started/neuromag">http://fieldtrip.fcdonders.nl/getting_started/neuromag</a> . Once the data are read into FieldTrip you can just save them as MATLAB files and you should be able to treat them the same as data from any other source once they're in FieldTrip's format.<br>
<br>Best,<br>Steve Politzer-Ahles<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 12, 2012 at 12:22 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:fieldtrip-request@donders.ru.nl">fieldtrip-request@donders.ru.nl</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
Message: 4<br>
Date: Thu, 12 Apr 2012 13:21:38 -0400<br>
From: Candida Jane Maria Ustine <<a href="mailto:candida@nmr.mgh.harvard.edu">candida@nmr.mgh.harvard.edu</a>><br>
To: <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
Subject: [FieldTrip] Running the ICA method to remove EOG/ECG artifact<br>
        on      Neuromag(*.fif) data<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:CAJbuNUMHAiyakB92ZmSR6vjeWnhXM80fgsJa4kFj2DE6fxPihQ@mail.gmail.com">CAJbuNUMHAiyakB92ZmSR6vjeWnhXM80fgsJa4kFj2DE6fxPihQ@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hello All,<br>
<br>
I have just started reading about fieldtrip and I am learning a lot of<br>
exciting things.<br>
<br>
I have MEG data using the neuromag system and I wanted to run the<br>
Independent Component Analysis on the .fif files to remove the EOG and ECG<br>
artifact from them. I see that the documentation provided in the website(<br>
<a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/example/use_independent_component_analysis_ica_to_remove_eog_artifacts" target="_blank">http://fieldtrip.fcdonders.nl/example/use_independent_component_analysis_ica_to_remove_eog_artifacts</a>)<br>

has resources to handle CTF datasets, and I was wondering if anyone has<br>
looked into the option of using the .fif files directly.<br>
Or is there a way to convert the *.fif files to the CTF format as there is<br>
an MNE utility to do the reverse mne_ctf2fif?<br>
<br>
Thanks much for your time and help!<br>
<br>
Best,<br>
Candida<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
Candida Jane Maria Ustine<br>
Martinos Center for Biomedical Imaging<br>
MGH<br>
Kuperberg Lab <<a href="http://kuperberglab.nmr.mgh.harvard.edu/" target="_blank">http://kuperberglab.nmr.mgh.harvard.edu/</a>><br>
<br>
 The information in this e-mail is intended only for the person to whom it<br>
is addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the<br>
e-mail contains patient information, please contact the Partners Compliance<br>
HelpLine at <a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent<br>
to you in error but does not contain patient information, please contact<br>
the sender and properly dispose of the e-mail.<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20120412/f79ae1c8/attachment.html" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20120412/f79ae1c8/attachment.html</a>><br>

<br>
------------------------------<br>
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_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<br>
End of fieldtrip Digest, Vol 17, Issue 11<br>
</blockquote></div>