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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Hi Sophie<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Are you sure that the correct version of the biosemi2ft (so the one for the mac) is in the folder that you are specifying? Maybe you can try it
 first without the optional parameters, so just<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH">../fieldtrip/realtime/acquisition/biosemi/biosemi2ft<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Best, Marianne<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> fieldtrip-bounces@donders.ru.nl [mailto:fieldtrip-bounces@donders.ru.nl]
<b>On Behalf Of </b>Sophie ADAMA<br>
<b>Sent:</b> vrijdag 10 februari 2012 14:54<br>
<b>To:</b> 'Email discussion list for the FieldTrip project'<br>
<b>Subject:</b> Re: [FieldTrip] signal acquisition with Biosemi<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Hi,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">I tried it on Windows too, and it works perfectly.
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">But I’m a Mac girl
</span><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Wingdings;color:#1F497D">J</span><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"> and I will be happy if someone could help me.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Thank you<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> fieldtrip-bounces@donders.ru.nl [mailto:fieldtrip-bounces@donders.ru.nl]
<b>On Behalf Of </b>Hamza Fawzi Altakroury (Student)<br>
<b>Sent:</b> vendredi 10 février 2012 06:26<br>
<b>To:</b> Email discussion list for the FieldTrip project<br>
<b>Subject:</b> Re: [FieldTrip] signal acquisition with Biosemi<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><span lang="FR-CH">Hello,<br>
<br>
I tried the biosemi2tf.exe command it works well on Windows. <br>
<br>
But, unfortunately I don't know about the Mac OS.<br>
<br>
Best,<br>
<br>
Hamza<o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH">On Thu, Feb 9, 2012 at 9:37 PM, Sophie ADAMA <<a href="mailto:adama.sophie@gmail.com">adama.sophie@gmail.com</a>> wrote:<o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><span lang="FR-CH">Hi,<br>
<br>
Thanks for your response.<br>
<br>
I tried that but I get this: <b>command not found</b>. I am using Mac OS Lion. <br>
<br>
Any suggestions?<br>
<br>
Thanks<o:p></o:p></span></p>
<pre><span lang="FR-CH">Sophie <o:p></o:p></span></pre>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH">Le 09.02.12 17:56, Robert Oostenveld a écrit :
<o:p></o:p></span></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH">On behalf of Philip... <o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH">On 9 Feb 2012, at 15:31, Philip van den Broek wrote:<o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div>
<div>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Dear Sophie and Hamza,<o:p></o:p></span></p>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">The connection between the Biosemi Active2 system and the FieldTrip buffer is handled by interfacing software biosemi2ft (part of fieldtrip), and should be started from the
 terminal (mac) or command prompt (windows).<o:p></o:p></span></p>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">The interfacing software is located in the FieldTrip folder: ../fieldtrip/realtime/acquisition/biosemi/biosemi2ft<o:p></o:p></span></p>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">The BioSemi system needs a configuration (.cfg) file in which some acquisition-related settings are specified. Configuration files for the BioSemi system specify for example
 from how many channels data should be streamed and/or recorded, and whether the data should be downsampled. For more information about configuration files for different acquisition systems, see the
<a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/development/realtime/biosemi" target="_blank">
Fieldtrip website</a>.<o:p></o:p></span></p>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">To start the buffer that connects to the Biosemi Active2, open the terminal (Mac) or command prompt (PC) and in the folder where you would like to save your data execute (change
 path according to your system and location of fieldtrip toolbox): <o:p></o:p></span></p>
<pre><span lang="FR-CH">../fieldtrip/realtime/acquisition/biosemi/biosemi2ft <config_file> <gdf-file> <hostname> <port><o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><config_file>: configuration file<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><gdf-file>: base name of the gdf file. The suffix .gdf and session counters will be added automatically.<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><hostname>: optional, default is 'localhost', specify '-' to spawn a local buffer (recommended) <o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><port>: optional, default is 1972<o:p></o:p></span></pre>
</div>
<pre><span lang="FR-CH">an example:<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH">../fieldtrip/realtime/acquisition/biosemi/biosemi2ft myconfig.cfg myfile - 1972<o:p></o:p></span></pre>
<div>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Note that the manually specified name of the file will overwrite any existing file, so make sure myfile.gdf doesn't exist.<o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Once this is running, you get access to the data through the fieldtrip buffer filled with data by biosemi2ft, i.e., fieldtrip fileio functions give you access
 to the data:<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">ft_read_header('buffer://localhost:1972'), or<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">ft_read_data('buffer://localhost:1972','begsample',1,'endsample',100,........<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">For further information, see fieldtrip website.<o:p></o:p></span></p>
</div>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">(more info on how we use the system at our department can be found here: <a href="http://www.nici.ru.nl/brainstream/twiki/bin/view/BrainStreamDocs/DocsSectionsInstallation" target="_blank">http://www.nici.ru.nl/brainstream/twiki/bin/view/BrainStreamDocs/DocsSectionsInstallation</a>)<o:p></o:p></span></p>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Hope this helps you to get things running in your place. If you have any further questions, just let me know. <o:p></o:p></span></p>
<p><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Best regards,<o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif""><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Philip van den Broek<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH" style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">Radboud University Nijmegen<br>
Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour<br>
Centre for Cognition<br>
<br>
P.O. Box 9104, 6500 HE Nijmegen<br>
Montessorilaan 3, 6525 HR Nijmegen<br>
The Netherlands<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><span lang="FR-CH"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
</div>
<div>
<pre><span lang="FR-CH">_______________________________________________<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH">fieldtrip mailing list<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><o:p></o:p></span></pre>
<pre><span lang="FR-CH"><a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><o:p></o:p></span></pre>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH"><br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CH"><br>
<br clear="all">
<br>
-- <br>
Hamza Fawzi Altakroury<br>
Graduate student - MA<br>
Faculty of Engineering and Natural Sciences<br>
Sabancı University<o:p></o:p></span></p>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Verdana" color="Silver" size="1">Disclaimer<br>
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<br>
Sint Maartenskliniek<br>
Hengstdal 3,<br>
6574 NA Ubbergen (bij Nijmegen)<br>
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KvK nummer 41055111<br>
</font>
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</html>