Thank you for your help. I realigned it to Tailarach prior to freesurfer processing. Any idea?<div><br></div><div>Ion <br><br><div class="gmail_quote">2012/1/19 Stolk, A. <span dir="ltr"><<a href="mailto:a.stolk@fcdonders.ru.nl">a.stolk@fcdonders.ru.nl</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:12pt;font-family:Times New Roman"><p>Hi Ion,</p>
<p> </p>
<p>Did you realign your anatomical image to Talairach space (and not accidentally to MNI space) prior to the processing with Freesurfer?</p>
<p> </p>
<p><a href="http://imaging.mrc-cbu.cam.ac.uk/imaging/FindingCommissures" target="_blank">http://imaging.mrc-cbu.cam.ac.uk/imaging/FindingCommissures</a></p>
<p> </p>
<p>Best regards,</p>
<p>Arjen</p>
<p> </p>
<p><br>----- "Ion Lavado" <<a href="mailto:lavado@gmail.com" target="_blank">lavado@gmail.com</a>> schreef: <br>> Van: "Ion Lavado" <<a href="mailto:lavado@gmail.com" target="_blank">lavado@gmail.com</a>><br>
> Aan: <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>> Verzonden: Donderdag 19 januari 2012 09:25:16<br>> Onderwerp: [FieldTrip] Source reconstruction with MNE problem: vol doen's fit        sourcespace</p>
<div class="im"><br>><br>> Hello, i'm trying a source reconstruction of event related fields using minimun-norm estimates and i get a problem with vol and sourcespace. When plot them together the vol doesn't fit the sourcespace. I adjunted in the mail two images where you can see what i get. It looks like that there isn't any problem of coordinate system also the units seem to be ok. I also procesed all the file with freesurfer so i suppose there is no problem with the orig-nomask.mgz.</div>
<p></p><div class="im">
<div>Hope anyone can help me. Thank you very much.</div>
<div><br>> </div>
<div>Ion</div><br></div>> _______________________________________________<br>> fieldtrip mailing list<br>> <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>> <a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></div>
</div><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>