Hello,<div><br></div><div>I'm trying to use some of the plot tools for results from ft_connectivityanalysis. Can anyone tell me what the horizontal and vertical axes represent in ft_connectivityplot? The values differ on each plot in the matrix and don't seem to correspond to the data. Also, in ft_topoplotCC, is it possible to weight the line font based on the magnitude of the coherence value?</div>
<div><br></div><div><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;color:#228e28">%% step 1 | freq analysis</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;color:#228e28;min-height:14.0px"> </p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg            = [];</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;color:#a83df1"><span style="color:#000000">cfg.channel    = {</span>'A224'<span style="color:#000000">, </span>'A188'<span style="color:#000000">, </span>'A189'<span style="color:#000000">, </span>'A163'<span style="color:#000000">, </span>'A184'<span style="color:#000000">,</span>'A162'<span style="color:#000000">};</span></p>

<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.method     = <span style="color:#a83df1">'mtmfft'</span>;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.output     = <span style="color:#a83df1">'fourier'</span>;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.foilim     = [8 12];</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.toi        = 2.35:0.01:2.65;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.keeptrials = <span style="color:#a83df1">'yes'</span>;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.keeptapers = <span style="color:#a83df1">'yes'</span>;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.tapsmofrq  = 2;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.taper      = <span style="color:#a83df1">'dpss'</span>;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;min-height:14.0px"> </p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">freq_alpha     = ft_freqanalysis(cfg, data_spctrm);</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;min-height:14.0px"> </p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;min-height:14.0px"> </p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;color:#228e28">%% step 2 | connectivity analysis</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;color:#228e28;min-height:14.0px"> </p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg            = [];</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">cfg.method     = <span style="color:#a83df1">'coh'</span>;</p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier;min-height:14.0px"> </p>
<p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">coh            = ft_connectivityanalysis(cfg, freq_alpha);</p><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier"><br></p><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">
<br></p><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier"><br></p><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">Thanks for any feedback,</p><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">karl doron</p><p style="margin:0px 0px 0px 0px;font:12.0px Courier">
UC, Santa Barbara</p></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div>