Forget to mention, after this commands on freesurfer:<br><pre class="code">recon-all -talairach -subjid Subject01
recon-all -nuintensitycor -subjid Subject01
recon-all -normalization -subjid Subject01
cp T1.mgz brainmask.mgz
recon-all -gcareg -subjid Subject01
recon-all -canorm -subjid Subject01
recon-all -careg -subjid Subject01
recon-all -calabel -subjid Subject01
recon-all -normalization2 -subjid Subject01
recon-all -segmentation -subjid Subject01
recon-all -fill -subjid Subject01<br><br><br></pre>I have the mri folder with the tmp folder in it but it is empty...<br><br>Thank you.<br><br><div class="gmail_quote">2012/1/13 Ion Lavado <span dir="ltr"><<a href="mailto:lavado@gmail.com">lavado@gmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hello, i'm trying source reconstruction using Minimum-Norm Estimates and i have a problem when reading the (filled.mgz) or any other .mgz file after using Freesurfer and created the files.<br>
This is the ERROR i get:<br>
<br><br>>> mri=ft_read_mri(<span style="color:rgb(102,0,204)">'F:\SUBJECT29_BUENO\Subject29\mri\filled.mgz</span>');<br>The system cannot find the path specified. <br>ERROR: could not open /tmp/tmp7914012.mgh for reading<br>

ERROR: loading F:\SUBJECT29_BUENO\Subject29\mri\filled.mgz as MGH<br><span style="color:rgb(204,0,0)">??? Attempt to reference field of non-structure array.</span><br style="color:rgb(204,0,0)"><span style="color:rgb(204,0,0)">Error in ==> ft_read_mri at 248</span><br style="color:rgb(204,0,0)">

<span style="color:rgb(204,0,0)">  ndims = numel(size(tmp.vol));</span><br><br>Hope anyone can help me. Thanks!<br>
</blockquote></div><br>