Thank you Stephen & Lilla!<div><br></div><div>I think I am just a bit overwhelmed with my data...and I was hoping to get straightforward results for my epoch...</div><div><br></div><div><br><div class="gmail_quote">On Fri, Oct 7, 2011 at 2:08 PM, Magyari, Lilla <span dir="ltr"><<a href="mailto:Lilla.Magyari@mpi.nl">Lilla.Magyari@mpi.nl</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">hi Zita,<br>
<br>
I do not know what kind of script you wrote, therefore, it is difficult to figure out what the problem is exactly. But your problems reminds me to the following:<br>
if you followed the FT tutorial for plotting the clusters, you must be aware that it will plot only those channels in each time-bin that are part of the cluster during the entire time-bin. So, if you use a 50 ms bin, and a channel is part of the significant cluster only for 10 ms, you won't see that channel on the plot. I hope this helps.<br>

<br>
Best,<br>
Lilla<br>
<br>
<br>
Zita Eva Patai wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im">
Sorry, I know the answer now, but I have another , similar problem:<br>
<br>
When i get the clusterplot figure (after i run the cluster analysis), it has the timebins every 4ms (bc i have a 250Hz sampling rate) with the significant clusters plotted. For a simplified plotting, i was trying to use the bit of script where i can specify the timesteps i want the clusters to be shown in (ex: every 50ms)<br>

But, depending on what timestep i use, sometimes it does not display the clusters that are significant, almost like if the period is not long enough, it will not show the clusters...<br>
<br>
Any ideas ?<br>
<br>
Thank you!<br>
<br></div><div class="im">
On Fri, Oct 7, 2011 at 10:18 AM, Zita Eva Patai <<a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a> <mailto:<a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a><u></u>>> wrote:<br>

<br>
    Dear All<br>
<br>
    I am running the Cluster-based permutation tests on event related<br>
    fields, and for the same dataset, with all settings identical, when<br>
    i run:<br>
    0-200ms: i get one significant cluster<br>
    but:<br>
    0-500ms: no significant clusters<br>
<br>
    why does my significant cluster disappear depending on the time<br>
    window i use?<br>
<br>
    thank you!<br>
    z<br>
<br>
<br>
    -- <br>
    Zita Patai<br>
    DPhil Candidate, Experimental Psychology<br>
    University of Oxford<br>
    <a href="http://bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-eva-patai/" target="_blank">bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-<u></u>eva-patai/</a><br></div>
    <<a href="http://bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-eva-patai/" target="_blank">http://bcl.psy.ox.ac.uk/<u></u>people/zita-eva-patai/</a>><br>
    <a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a> <mailto:<a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a><u></u>><div class="im"><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
-- <br>
<br>
Zita Patai<br>
DPhil Candidate, Experimental Psychology<br>
University of Oxford<br>
</div><a href="http://bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-eva-patai/" target="_blank">bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-<u></u>eva-patai/</a> <<a href="http://bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-eva-patai/" target="_blank">http://bcl.psy.ox.ac.uk/<u></u>people/zita-eva-patai/</a>><br>

<a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a> <mailto:<a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a><u></u>><br>
<br>
<br>
<br>
------------------------------<u></u>------------------------------<u></u>------------<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/<u></u>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</blockquote>
<br>
-- <br>
PhD student<br>
Language and Cognition Group<br>
research assistant<br>
Neurobiology of Language Group<br>
<br>
Max Planck Institute for Psycholinguistics<br>
Nijmegen, P.O. Box 310, 6500AH, the Netherlands<br>
Phone: 0031 24 3521561<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/<u></u>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><br></div><div>Zita Patai</div><div>DPhil Candidate, Experimental Psychology</div><div>University of Oxford</div><div><a href="http://bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-eva-patai/" target="_blank">bcl.psy.ox.ac.uk/people/zita-eva-patai/</a></div>
<div><a href="mailto:eva.patai@psy.ox.ac.uk" target="_blank">eva.patai@psy.ox.ac.uk</a></div><div><br></div><br>
</div>