Mark,<br><br>I don't have an answer to your problem, but I have noticed a similar issue with data from Neuroscan (like your data, mine seems more attenuated by the Fieldtrip filter than the Neuroscan one; here is a comparison using a 30Hz low-pass in Fieldtrip with the default options, versus 30Hz in Neuroscan with zero phase shift and 12 dB/oct: <a href="http://img685.imageshack.us/img685/5717/fieldtrippreprocessing.png">http://img685.imageshack.us/img685/5717/fieldtrippreprocessing.png</a>). I'd also be interested to hear if anyone on the list knows about what filter settings to adjust to replicate those settings.<br>
<br>Best,<br>Steve Politzer-Ahles<br><br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<br>
Message: 5<br>
Date: Fri, 23 Sep 2011 18:09:18 +0200<br>
From: Mark Noordenbos <<a href="mailto:mark.noordenbos@gmail.com">mark.noordenbos@gmail.com</a>><br>
To: <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
Subject: [FieldTrip] Filter settings (Fieldtrip vs Brainvision<br>
        Analyzer)<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:CAJSb8nOKezCwZKLay6PjHKGf7tHzfVCgsEDjtxWgYvWNf7NY1Q@mail.gmail.com">CAJSb8nOKezCwZKLay6PjHKGf7tHzfVCgsEDjtxWgYvWNf7NY1Q@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Dear all,<br>
<br>
I analyzed some data using Brainvision Analyzer and would like to re-analyze<br>
the same data using Fieldtrip. However, the final results are a bit<br>
different between Brainvision Analyzer and Fieldtrip.<br>
The main difference is because of differences in filtering of the data<br>
(without filtering the data is exactly the same). The filter in Fieldtrip<br>
seems to be much 'stricter' and as a consequence the amplitude is almost<br>
halved in the grandaverage!<br>
<br>
In Brainvision Analyzer I used the following filter setting:<br>
<br>
Butterworth Zero Phase Filters<br>
Low Cutoff: 1.0000 Hz, Time constant 0.1592s, 24 dB/oct<br>
High Cutoff: 30.0000 Hz, 24 dB/oct<br>
Notch Filter: ---<br>
<br>
In Fieldtrip I used the following filter settings<br>
<br>
cfg.lpfilter                = 'yes';<br>
cfg.hpfilter                = 'yes';<br>
cfg.lpfreq                  = 30;<br>
cfg.hpfreq                  = 1;<br>
<br>
cfg.lpfiltord = 6;<br>
cfg.hpfiltord = 6;<br>
<br>
cfg.lpfiltdir     = 'twopass';<br>
cfg.hpfiltdir     = 'twopass';<br>
<br>
Any suggestions for the Fieldtrip filter settings to resemble the<br>
Brainvision Analyzer filter settings as much as possible?<br>
<br>
Best,<br>
Mark<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20110923/eccb307f/attachment.html" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20110923/eccb307f/attachment.html</a>><br>

-------------- next part --------------<br>
A non-text attachment was scrubbed...<br>
Name: fieldtripvsbva.jpg<br>
Type: image/jpeg<br>
Size: 26475 bytes<br>
Desc: not available<br>
URL: <<a href="http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20110923/eccb307f/attachment.jpg" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/attachments/20110923/eccb307f/attachment.jpg</a>><br>

<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<br>
End of fieldtrip Digest, Vol 10, Issue 34<br>
*****************************************<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Stephen Politzer-Ahles<br>University of Kansas<br>Linguistics Department<br><a href="http://www.linguistics.ku.edu/">http://www.linguistics.ku.edu/</a><br>