To summarize, the ICA will decompose your signal into as many components as Electrodes.<div>Therefore, trying to decompose only one source is useless.</div><div>Did you use a full net of electrodes into your MRI machine or only EOG electrodes?</div>
<div><br></div><div>Hope this helps, </div><div><br></div><div>Rodolphe N.<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jun 16, 2011 at 11:42 AM, <a href="mailto:frank@greenant.net">frank@greenant.net</a> <span dir="ltr"><<a href="mailto:fieldtrip@greenant.net">fieldtrip@greenant.net</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">I am trying to use fieldtrip to filter EOG data obtained in an MRI.<br>
I want to be able to spot the saccades in the samples and ideally measure their onset at the<br>
end of each trial.<br>
<br>
As you may guess, it's quite noisy and it's broad spectrum noise, despite pre-filtering.<br>
<br>
Ideally, I would like to isolate the component that corresponds to the MRI interference<br>
and then filter this out.<br>
<br>
I have managed to import the data and can run ft_componentanalysis<br>
but it fails with:<br>
<br>
runica() - data size (1,30720) too small<br>
<br>
My data is single channel, 40 epochs, each of 6 seconds (time locked to stim onset but not saccade onset)<br>
Is there a different method I should be using?<br>
<br>
I have posted some sample data and the current script (which reads in the<br>
data and runs preprocessing) to the following urls:<br>
<br>
<a href="http://greenant.net/temp/1_2_MRI_2011-04-29%2016:19:33.mat" target="_blank">http://greenant.net/temp/1_2_MRI_2011-04-29%2016:19:33.mat</a><br>
<a href="http://greenant.net/temp/EOG_analysis.m" target="_blank">http://greenant.net/temp/EOG_analysis.m</a><br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</blockquote></div><br></div>