<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
<style>
<!--
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.E-MailFormatvorlage17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:Arial;
        color:windowtext;}
p.FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt, li.FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt, div.FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:10.0pt;
        font-family:Arial;}
p.FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt1, li.FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt1, div.FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt1
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:10.0pt;
        font-family:Arial;}
@page Section1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 90.0pt 72.0pt 90.0pt;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style>
<!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="2050" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>

<body lang=DE link=blue vlink=purple>

<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>Dear all, <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>I have a question concerning cluster based
permutation statistics.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>It is more a basic question on the difference between
one- and two-sided testings. I recall from simple t-tests that as an approach
to your two-sided p-value you can multiply your one-sided p-value by 2. I hope
this is correct? And I am assuming this to also hold in the other direction,
thus, approximating your one-sided p-value by dividing your two-sided p-value by
2?<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>That is why I am expecting something similar when
calculating my statistics with a cluster based permutation approach.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>So what I am actually doing is comparing two
conditions at one sensor, comparing time-frequency data. <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>When I calculate a two-sided dependent samples t-test
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>(cfg = [];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.channel =
'all';                             
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.latency = [0.5
1.5];                              
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.avgoverchan = 'no';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.avgovertime = 'no';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.parameter =
'powspctrm';                 
    <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.method = 'montecarlo';                         
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.statistic = 'depsamplesT';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.correctm = 'cluster';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.clusteralpha = 0.05;<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.clusterstatistic =
'maxsum';                   
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.tail =
0;                                      
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.clustertail =
0;                               
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.alpha = 0.025;<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>cfg.numrandomization = 1000;  <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>)<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>, I find one positive cluster with a p-value of
0.036, thus not significant (see fig 1).<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-GB style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>When I then change my settings to a one-sided test<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=FR style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>(cfg.tail = 1;                                      
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=FR style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>cfg.clustertail =
1;                               
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=FR style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>cfg.alpha = 0.05;)<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>, the positive cluster gets a p-value of 0.056, again
not significant (see fig 2). <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>With the assumption described above, however, I would
expect this to become significant when using a one-sided test. Is my assumption
correct? If not, could anybody comment on what is wrong about my assumption?<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>I would be very grateful for any advice!<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>Kind regards and thank you very much in advance! <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'>Nina<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span lang=EN-US style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
lang=EN-GB style='font-size:10.0pt'>- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
lang=EN-GB style='font-size:10.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
lang=EN-GB style='font-size:10.0pt'>Nina Kahlbrock<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
lang=EN-GB style='font-size:10.0pt'>Institute of Clinical Neuroscience and
Medical Psychology <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'>Heinrich Heine University Duesseldorf<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'>Universitaetsstr.  1<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'>40225  Düsseldorf<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'>Tel.:      +49 211 81 18075<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'>Fax. .:   +49 211 81 19916<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt'>Mail:     </span></font><span lang=FR><a
href="mailto:Nina.Kahlbrock@med.uni-duesseldorf.de"><font color=black><span
lang=DE style='color:windowtext;text-decoration:none'>Nina.Kahlbrock@med.uni-duesseldorf.de</span></font></a></span><o:p></o:p></p>

<p class=FormatvorlageArial10ptVor5ptNach5pt><font size=2 face=Arial><span
lang=FR style='font-size:10.0pt'><a
href="http://www.uniklinik-duesseldorf.de/medpsychologie"><font color=black><span
lang=DE style='color:windowtext;text-decoration:none'>http://www.uniklinik-duesseldorf.de/medpsychologie</span></font></a></span><o:p></o:p></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

</div>

</body>

</html>