Hi Karl,<div><br></div><div>In short, the former method gives you a mixture of time-locked power changes and and the inter-trial phase coherence, since departures from perfect phase locking will attenuate the amplitude of the average of your trials in the time domain. Taking the hilbert amplitude envelope of single trials and then averaging will yield the closest we can get the 'induced' response, or time-locked power changes. </div>
<div>To reiterate, averaging in the time domain confounds power changes and phase differences between trials. A good paper that touches on these topics is Makeig et al. (2004) "Mining event-related brain dynamics".</div>
<div>I'm sure my comments on single-trial power as the 'induced' response will cause a stir here, and if you look in the archives there are extensive past discussions on the topic of isolating the 'induced' response from the 'evoked' (phase-locked)</div>
<div><br></div><div>Hope that helps some,</div><div><br></div><div>- Adrian M. Bartlett</div><div>Department of Psychology (MA Candidate)</div><div>Neuroscience Graduate Diploma Program</div><div>Perception & Plasticity Laboratory</div>
<div>Centre for Vision Research</div><div>York University</div><div><a href="http://www.yorku.ca/~khoffman/">http://www.yorku.ca/~khoffman/</a></div><div><br><div class="gmail_quote">On Thu, May 20, 2010 at 2:41 PM, Karl Doron <span dir="ltr"><<a href="mailto:karl.doron@gmail.com">karl.doron@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">Hello,<br>
<br>
I wonder if anyone can help me understand (or point me to a reference) the practical<br>
consequences of getting the analytic amplitudes of individual trials and then averaging those<br>
vs. averaging band pass filtered data, and then getting the analytic amplitude.<br>
<br>
Many thanks,<br>
karl doron<br>
<br>
----------------------------------<br>
The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis. See also <a href="http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html" target="_blank">http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</a> and <a href="http://www.ru.nl/neuroimaging/fieldtrip" target="_blank">http://www.ru.nl/neuroimaging/fieldtrip</a>.<br>

</blockquote></div><br></div>
<p>----------------------------------</p>
<p>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis.</p>
<p>  http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</p>
<p>  http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip/</p>