<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7654.12">
<TITLE>BUG in ft_topoplotER (cfg.xlim) version 20100127</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Dear all,<BR>
<BR>
I wanted to report a bug in ft_topoplotER (Fieldtrip version 20100127), regarding the use of cfg.xlim. It doesn't seem to use cfg.xlim when you choose one, but just to use the 'maxmin'. When I average the data over xlim myself I get a completely different topoplot then when I use cfg.xlim for the same range. I wouldn't have known if I didn't need to average over xlim for other reasons.<BR>
<BR>
It seems to happen between lines 445 and 452. The data are selected for cfg.ylim and cfg.component but not for cfg.xlim. This changes the outlook on my data completely, and I think this could be important for all users of this version. Therefore I send it to the entire mailing list.<BR>
<BR>
I have changed it now to:<BR>
444 % make dat structure with one value for each channel<BR>
445 dat = getsubfield(data, cfg.zparam);<BR>
446 if ~isempty(cfg.yparam),<BR>
447   dat = dat(:, ymin:ymax, xmin:xmax);<BR>
448   dat = nanmean(nanmean(dat, 2), 3);<BR>
449 elseif ~isempty(cfg.component) | ~isempty(cfg.xlim);%this part Hanneke added<BR>
450  dat = dat(:, xmin:xmax);<BR>
451  dat = nanmean(dat, 2);<BR>
452 end<BR>
453<BR>
454 dat = dat(:);<BR>
<BR>
This helps for me and it is very important for me as well, my data looks meaningfull now!<BR>
<BR>
Best and good luck!<BR>
<BR>
Hanneke<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
--------------------------------------------------<BR>
Institut für Klinische Neurowissenschaften und Medizinische Psychologie<BR>
Gebäude-Nr.: 23.02<BR>
Ebene: 03 Zimmer-Nr.: 47<BR>
Tel.:  0211-81-13074<BR>
Mail : hanneke.vandijk@med.uni-duesseldorf.de<BR>
<A HREF="http://www.uniklinik-duesseldorf.de/deutsch/unternehmen/institute/KlinNeurowiss/Team/HannekevanDijk/page.html">http://www.uniklinik-duesseldorf.de/deutsch/unternehmen/institute/KlinNeurowiss/Team/HannekevanDijk/page.html</A><BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>
<p>----------------------------------</p>
<p>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis.</p>
<p>  http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</p>
<p>  http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip/</p>