Now there is an attachment too! sorry<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jul 10, 2009 at 4:08 PM, Hanneke Van Dijk <span dir="ltr"><<a href="mailto:Hanneke.vanDijk@med.uni-duesseldorf.de">Hanneke.vanDijk@med.uni-duesseldorf.de</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Dear all,<br>
<br>
I have entered the next step: sourceanalysis. But I have encountered another problem, I think in sourceinterpolation or maybe volumenormalise.<br>
<br>
After running the script as I have described before (to make the headmodel and the grid) I do the following;<br>
<br>
load f %load frequency data<br>
cfg                = [];<br>
cfg.grid           = grid;<br>
cfg.frequency      = 10;<br>
cfg.vol            = hdm;<br>
cfg.grad           = f.grad;<br>
cfg.projectnoise   = 'yes';<br>
cfg.lambda         = 5e-28;<br>
cfg.method         = 'dics';<br>
cfg.feedback       = 'textbar';<br>
<br>
source = sourceanalysis(cfg,f);<br>
<br>
then:<br>
<br>
sd = sourcedescriptives([],source);<br>
<br>
then:<br>
<br>
load norm %normalized to MNI brain of single subject<br>
sdint = sourceinterpolate([], sd , norm);<br>
clear norm<br>
%plotting the results<br>
cfg.funparameter = 'avg.nai';<br>
cfg.anaparameter = 'anatomy';<br>
cfg.funcolormap  = 'jet';<br>
cfg.method       = 'ortho';<br>
cfg.projmethod   = 'nearest';<br>
cfg.sphereradius = 20;<br>
cfg.surffile     = 'surface_l4_both';<br>
figure;<br>
sourceplot(cfg,sdint)<br>
<br>
The result is attached to this email, the gird seems to have moved upwards and somewhat to the front relative to the normalised mri. But it seems to have the right size. I have been playing around with sourceunits mriunits x-y coordinates but nothing helps, or it makes it even worse.<br>

<br>
Does anybody have an idea what's happening?<br>
<br>
Yours,<br>
Hanneke<br>
<br>
<a href="http://www.linkedin.com/in/hannekevandijk" target="_blank">www.linkedin.com/in/hannekevandijk</a><br>
tel. +49 (0)211 81 13074<br>
<br>
<br>
<br>
----------------------------------<br>
The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis. See also <a href="http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html" target="_blank">http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</a> and <a href="http://www.ru.nl/neuroimaging/fieldtrip" target="_blank">http://www.ru.nl/neuroimaging/fieldtrip</a>.<br>

</blockquote></div><br>
<p>----------------------------------</p>
<p>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis.</p>
<p>  http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</p>
<p>  http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip/</p>