<div>dear jan mathijs,</div>
<div> </div>
<div>i have been generating a single shell model from the segmented mri. the localisation proceedure is for a tactile stimulus so when i see a contralateral S1 response i have some reason to belive that the algorithm is making some sense. I get the impression from your reply that there is no easy way to get around this lack of anatomical data and that i may just have to go and get the mri's done for this couple of subjects!
</div>
<div> </div>
<div>thanks for your thoughts on this,</div>
<div> </div>
<div>tom.</div>
<div><br> </div>
<div><span class="gmail_quote">On 1/7/08, <b class="gmail_sendername">Jan Mathijs Schoffelen</b> <<a href="mailto:jan.schoffelen@fcdonders.ru.nl">jan.schoffelen@fcdonders.ru.nl</a>> wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Dear Tom,<br><br>As far as I know, the 'ctf-format' standardised mri does not exist. Creating an anatomically accurate forward model, while the actual anatomical information is lacking, is tricky business. What kind of forward model do you actully use? The multiple sphere model based on the ctf-shape files? If so, you could try to come up with an 'averaged' multipsphere model (thus bypassing the need for a standardised MRI), although this is not trial.  However, I wonder whether this would yield better results than just taking an 'averaged' single sphere model.
<br>I wonder what you mean by your statement that localisation is much more accurate when using ctf-formatted MRIs. Do you  know where your activation should end up then?<br><br>The function beamformer_pcc is as far as I know still in its experimental stage and only for use within the FC Donders Centre. However, beamformer_dics shares most of the functionality, but obviously not all of it.
<br><br>Regards,<br><br>Jan-Mathijs<br><br>----------------------------------<br>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis. See also
<a href="http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html">http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</a> and <a href="http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip">http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip</a>.<br></blockquote>
</div><br>
<p>----------------------------------</p>
<p>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis.</p>
<p>  http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</p>
<p>  http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip/</p>