<div>Hi Robert,</div>
<div> </div>
<div>I'm using the BEM head model you supplied, and have a quick question about it. From plotting the results of this approach, the grid appears to only extend as low as the level of the anterior commisure. Is this intended? If so, I presume it's because of the difficulty in localizing deep sources? Thanks in advance.
</div>
<div> </div>
<div>-Jared<br><br> </div>
<div><span class="gmail_quote">On 7/7/07, <b class="gmail_sendername">Robert Oostenveld</b> <<a href="mailto:r.oostenveld@fcdonders.ru.nl">r.oostenveld@fcdonders.ru.nl</a>> wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">On 7 Jul 2007, at 5:12, Jared Van Snellenberg wrote:<br><br>> Quick question about the BEM model you supplied--is it correct to
<br>> just pass in the vol structure contained in the standard_vol.mat<br>> along with an elec structure containing the nx3 array of electrode<br>> coordinates in MNI space? That is, is the following correct:<br>
><br>> load standard_vol.mat<br>> cfg.vol=vol;<br>> cfg.elec=elec; %predefined; 59 electrode coordinates in MNI<br>> results=sourceanalysis(cfg,data);<br><br>Yes, but only if the electrode labels in your data match with the
<br>complete set or a subset of the labels in elec (it is case<br>sensitive). The intersection of data.label and elec.label will be<br>used for sourecanalysis. However, for EEG source analysis your data<br>should be average referenced. And that is something that you do
<br>during preprocessing (or optionally timelockanalysis). That means<br>that all channels in your data for which there is a corresponding<br>electrode position in the elec structure should be average referenced.<br><br>Prior to sourceanalysis, you can use the headmodelplot function (or
<br>electroderealign with method=interactive) to check that the<br>electrodes ly on the skin compartment of the MNI head model.<br><br>regards,<br>Robert<br><br>----------------------------------<br>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis. See also
<a href="http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html">http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</a> and <a href="http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip">http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip</a>.<br></blockquote>
</div><br><br clear="all"><br>-- <br>Jared Van Snellenberg<br>Social Cognitive Affective Neuroscience Unit<br><a href="http://scan.psych.columbia.edu">http://scan.psych.columbia.edu</a><br>(212) 854-7858 p<br>(212) 854-3609 f
<br>Department of Psychology, Columbia University<br>406 Schermerhorn Hall<br>1190 Amsterdam Avenue, Mail Code 5501<br>New York, NY 10027<br>_______________________________<br>"Luck is the residue of design"<br>
-Attributed to Branch Rickey, former US Baseball Administrator, and also to John Milton. Go figure.
<p>----------------------------------</p>
<p>The aim of this list is to facilitate the discussion between users of the FieldTrip  toolbox, to share experiences and to discuss new ideas for MEG and EEG analysis.</p>
<p>  http://listserv.surfnet.nl/archives/fieldtrip.html</p>
<p>  http://www.ru.nl/fcdonders/fieldtrip/</p>