<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:st1="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
<!--[if !mso]>
<style>
v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style>
<![endif]--><o:SmartTagType
 namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="City"/>
<o:SmartTagType namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags"
 name="place"/>
<o:SmartTagType namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags"
 name="PersonName"/>
<!--[if !mso]>
<style>
st1\:*{behavior:url(#default#ieooui) }
</style>
<![endif]-->
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        text-align:right;
        direction:rtl;
        unicode-bidi:embed;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal;
        font-family:Arial;
        color:windowtext;}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
span.EmailStyle19
        {mso-style-type:personal;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
span.EmailStyle20
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
@page Section1
        {size:595.3pt 841.9pt;
        margin:72.0pt 90.0pt 72.0pt 90.0pt;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style>
<!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=Section1 dir=RTL>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Here is my suggestion for a fix. It should handle
any number of dimensions, which is perhaps slightly overkill for this case, but
hope it works. I tested it for time and frequency.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Best,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><st1:City w:st="on"><st1:place w:st="on"><font size=2 color=navy
  face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>Vladimir</span></font></st1:place></st1:City><font
size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial;
color:navy'><o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center dir=LTR style='text-align:center;direction:
ltr;unicode-bidi:embed'><font size=3 face="Times New Roman"><span
style='font-size:12.0pt'>

<hr size=3 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:
Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2 face=Tahoma><span
style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'> FieldTrip discussion list
[mailto:FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL] <b><span style='font-weight:bold'>On Behalf
Of </span></b>Vladimir Litvak<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Thursday, March 01, 2007
2:46 PM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> Re: [FIELDTRIP]
TopoplotTFR</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>I looked at the code and the problem is in line
264 of topoplotER where you assume that the yparam is always the second dimension
in the data and the xparam is always the third. When this assumption is false,
the code fails.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Best,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><st1:City w:st="on"><st1:place w:st="on"><font size=2 color=navy
  face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>Vladimir</span></font></st1:place></st1:City><font
size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial;
color:navy'><o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center dir=LTR style='text-align:center;direction:
ltr;unicode-bidi:embed'><font size=3 face="Times New Roman"><span
style='font-size:12.0pt'>

<hr size=3 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:
Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2 face=Tahoma><span
style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'> FieldTrip discussion list
[mailto:FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL] <b><span style='font-weight:bold'>On Behalf
Of </span></b>Jan Mathijs Schoffelen<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Thursday, March 01, 2007
12:13 PM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> Re: [FIELDTRIP]
TopoplotTFR</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Oops. I’m sorry, I misread your mail; I
thought you were talking about multiplotTFR.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Forget what I said before. To my knowledge, a
subplotted topoplotTFR only works in the time dimension, but I’m not
sure. Did you check the code?<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>So if it is true, that it only works in the time
dimension, there are two ways of doing what you want:<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Repeatedly call topoplotTFR for different
frequencies,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>or adjust the function such that it also works
the other way.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Maybe you could look into if and why the
assignment of the yparam and xparam should always be ‘time’, and
‘freq’ respectively. I guess the original reason stems from the
fact that we are used to depict TFRs like that.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Yours,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'>Jan-Mathijs<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'> <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;color:navy'><o:p> </o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center dir=LTR style='text-align:center;direction:
ltr;unicode-bidi:embed'><font size=3 face="Times New Roman"><span
style='font-size:12.0pt'>

<hr size=2 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:
Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2 face=Tahoma><span
style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'> <st1:PersonName w:st="on">FieldTrip
 discussion list</st1:PersonName> [mailto:FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL] <b><span
style='font-weight:bold'>On Behalf Of </span></b>Vladimir Litvak<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Thursday, March 01, 2007
1:00 PM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> [FIELDTRIP] TopoplotTFR</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Dear
all,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>I'm
trying to use topoplotTFR for multichannel data that has both time and
frequency dimension. When I configure:<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.xparam='time';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.yparam='freq';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.xlim=[-2:0.1:0];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.ylim=[8
12];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>I
get multiple plots corresponding to different time windows. However when I try:<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.xparam='freq';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.yparam='time';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.xlim=[0:2:40];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.ylim=[-1
0];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>or
<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.xparam='time';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.yparam='freq';<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.xlim=[-1
0];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>cfg.ylim=[0:2:40];<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>it
doesn't work. I either get an error or a single plot. How do I get a series of plots
for different frequencies with the same time window?<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Thanks,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><st1:place w:st="on"><st1:City w:st="on"><font size=2 face=Arial><span
  style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Vladimir</span></font></st1:City></st1:place><font
size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal dir=LTR style='text-align:left;direction:ltr;unicode-bidi:
embed'><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'><o:p> </o:p></span></font></p>

</div>

</body>

</html>