<DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">Dear Jan Mathijs and co,</SPAN></DIV>  <DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">thank you for your previous reply. After several trials, i was able to run the script; the problem seems to have something to do with the space and resources allocated to the user on our server.</SPAN></DIV>  <DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"></SPAN> </DIV>  <DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">I am able to get probabilities of coherence (for my subject group) for each channel, time and frequency bins. I just wanted to check that I am reading the probabilities correctly: even thought the statistic test is non parametric, significant differences are denoted by probability values of <0.05? Is this right?</SPAN></DIV>  <DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"></SPAN> </DIV>  <DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">Many thanks again - it is very exciting to have group data coherence results,  </SPAN></DIV>
  <DIV><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">Lorina</SPAN></DIV>  <DIV><BR><BR><B><I>Jan Mathijs Schoffelen <Jan.Schoffelen@FCDONDERS.RU.NL></I></B> wrote:</DIV>  <BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">  <META content="Microsoft Word 11 (filtered medium)" name=Generator>  <STYLE>  v\:* {behavior:url(#default#VML);}  o\:* {behavior:url(#default#VML);}  w\:* {behavior:url(#default#VML);}  .shape {behavior:url(#default#VML);}  </STYLE>  <?xml:namespace prefix = o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" /><o:SmartTagType name="place" namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags"></o:SmartTagType>  <STYLE>  st1\:*{behavior:url(#default#ieooui) }  </STYLE>    <STYLE>  <!--   /* Font Definitions */   @font-face   {font-family:Tahoma;   panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}   /* Style Definitions */   p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal   {margin:0in;   margin-bottom:.0001pt;   font-size:12.0pt;
 font-family:"Times New Roman";}  h1   {margin-top:12.0pt;   margin-right:0in;   margin-bottom:3.0pt;   margin-left:0in;   page-break-after:avoid;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-weight:bold;}  h2   {margin-top:12.0pt;   margin-right:0in;   margin-bottom:3.0pt;   margin-left:0in;   page-break-after:avoid;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-weight:bold;   font-style:italic;}  h3   {margin-top:12.0pt;   margin-right:0in;   margin-bottom:3.0pt;   margin-left:0in;   line-height:200%;   page-break-after:avoid;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-weight:bold;}  p.MsoToc5, li.MsoToc5, div.MsoToc5   {margin:0in;   margin-bottom:.0001pt;   font-size:11.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-style:italic;}  p.MsoBodyText, li.MsoBodyText, div.MsoBodyText   {margin-top:0in;   margin-right:0in;   margin-bottom:6.0pt;   margin-left:0in;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";}  a:link,
 span.MsoHyperlink   {color:blue;   text-decoration:underline;}  a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed   {color:blue;   text-decoration:underline;}  p   {mso-margin-top-alt:auto;   margin-right:0in;   mso-margin-bottom-alt:auto;   margin-left:0in;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";}  p.JMsstyle01, li.JMsstyle01, div.JMsstyle01   {margin:0in;   margin-bottom:.0001pt;   line-height:200%;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-weight:bold;}  p.JMsstyle02, li.JMsstyle02, div.JMsstyle02   {margin:0in;   margin-bottom:.0001pt;   line-height:200%;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-style:italic;}  p.JMsstyle03, li.JMsstyle03, div.JMsstyle03   {margin:0in;   margin-bottom:.0001pt;   text-align:justify;   line-height:200%;   font-size:12.0pt;   font-family:"Times New Roman";   font-weight:bold;   font-style:italic;}  span.EmailStyle23   {mso-style-type:personal-reply;   font-family:Arial;   color:navy;}  @page Section1
 {size:8.5in 11.0in;   margin:1.0in 1.25in 1.0in 1.25in;}  div.Section1   {page:Section1;}  -->  </STYLE>    <DIV class=Section1>  <DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial color=navy size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: navy; FONT-FAMILY: Arial">Dear Lorina,<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial color=navy size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: navy; FONT-FAMILY: Arial"><o:p> </o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial color=navy size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: navy; FONT-FAMILY: Arial">My outlook blocked your attached data. I managed to get it anyhow and ran your script. It runs through just fine. Apparently FT is doing what it should do.<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial color=navy size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: navy; FONT-FAMILY: Arial"><o:p> </o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial color=navy size=2><SPAN
 style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: navy; FONT-FAMILY: Arial">Yours, JM<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial color=navy size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: navy; FONT-FAMILY: Arial"><o:p> </o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal style="TEXT-ALIGN: center" align=center><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">  <HR tabIndex=-1 align=center width="100%" SIZE=2>  </SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><B><FONT face=Tahoma size=2><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold; FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Tahoma">From:</SPAN></FONT></B><FONT face=Tahoma size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Tahoma"> FieldTrip discussion list [mailto:FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL] <B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">On Behalf Of </SPAN></B>Lorina Naci<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Sent:</SPAN></B> Friday, December 08, 2006 1:01 PM<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">To:</SPAN></B>
 FIELDTRIP@NIC.SURFNET.NL<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Subject:</SPAN></B> Re: [FIELDTRIP] Within-subject coherence statististics for virtual sources</SPAN></FONT><o:p></o:p></DIV></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"><o:p> </o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">Dear Jan Mathijs and co,<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"><BR>thanks for following up with my queries. I feel very close to getting my result barring a few difficulties.<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <BLOCKQUOTE style="BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: medium none; MARGIN-TOP: 5pt; PADDING-LEFT: 4pt; MARGIN-BOTTOM: 5pt; PADDING-BOTTOM: 0in; MARGIN-LEFT: 3.75pt; BORDER-LEFT: #1010ff 1.5pt solid; PADDING-TOP: 0in; BORDER-BOTTOM: medium
 none">  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">> From the other statfun_xxx functions in the fieldtrip ‘private’ <BR>> folder, I thought that the statfun_depsamplesT would be more <BR>> appropriate for calculating the t statistic for my two conditions. <BR>> However, when I modify my script by substituting cfg.statistic = <BR>> ‘diff’ for cfg.statistic = ‘depsamplesT’ and run it, it crashes.<BR><BR>could you be a bit more specific about why it crashes? Theoretically it shouldn't crash, but I am not aware of the intricacies of the function.<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"> <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV></BLOCKQUOTE>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">I have run the script (attached) several times and get slightly different errors
 each time. The last error version i get is 'Segmentation violation occurred within signal handler. Unable to complete stack trace; stack was probably corrupted.' Any hints as to what this may mean? I've also attached here my data structures (6 subjects, two conditions (XM, <?xml:namespace prefix = st1 ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" /><st1:place w:st="on">Vis</st1:place>) each), just in case.<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"> <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">>It might be worthwhile to check whether there is a statfun_paired-tstat in the release-version, >which should do the same trick. <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE:
 12pt"> <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">I did look into the most recent version of Fieldtrip (07.12.2006) and don't think this function is available.<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"> <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">Many thanks,<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">Lorina<o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV>  <DIV><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">  <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="TEXT-ALIGN: center" align=center><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">  <HR align=center width="100%"
 SIZE=1>  </SPAN></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"><A href="http://us.rd.yahoo.com/mail/uk/taglines/default/nowyoucan/spamguard/*http:/us.rd.yahoo.com/evt=40565/*http:/uk.docs.yahoo.com/nowyoucan.html">All New Yahoo! Mail</A> – Tired of Vi@gr@! come-ons? Let our SpamGuard protect you. <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV></DIV></BLOCKQUOTE><BR><p> Send instant messages to your online friends http://uk.messenger.yahoo.com