<div>Hi Robert,</div>
<div> </div>
<div>I've rerun the analysis with mri's that were reoriented to MNI, and the same problem has emerged.</div>
<div> </div>
<div>The typo you noted in your last email was indeed the reason for the empty src plot. Plotting src, interp, volume, and grandavg, everything looks ok. The 'pow' parameter values all appear within the brain. The tscore and p values in stat, however, are all messed up. I've attached .bmp's from using sourceplot on grandavg and stat to this email. The quality is poor (matlab's figure window doesn't ever save bmp's very well), but it should demonstrate the problem clearly. Note all the large values outside of the brain.
</div>
<div> </div>
<div>Any comments you have would be greatly appreciated. I've considered just masking out everything that's not in the brain, but I'm not confident that the within-brain values are accurate.</div>
<div> </div>
<div>Thanks,</div>
<div> </div>
<div>-Jared<br><br> </div>
<div><span class="gmail_quote">On 10/12/06, <b class="gmail_sendername">Robert Oostenveld</b> <<a href="mailto:r.oostenveld@fcdonders.ru.nl">r.oostenveld@fcdonders.ru.nl</a>> wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">On 11 Oct 2006, at 19:16, Jared Van Snellenberg wrote:<br>> Thanks very much, it looks like you're right.
<br>good.<br><br>> While plotting the src data just came up with an empty image<br><br>In sourceplot cfg.funparameter should specify the parameter that<br>should be plotted, and that should work without anatomy as well.
<br>Looking back at your own cfg in the previous mail, I do think that it<br>should be 'pow'. However, I made a typo in my previous reply<br>(cfg.funparameyter).<br><br>Robert<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>
-- <br>Jared Van Snellenberg<br>Social Cognitive Affective Neuroscience Unit<br><a href="http://scan.psych.columbia.edu">http://scan.psych.columbia.edu</a><br>(212) 854-7858 p<br>(212) 854-3609 f<br>Department of Psychology, Columbia University
<br>406 Schermerhorn Hall<br>1190 Amsterdam Avenue, Mail Code 5501<br>New York, NY 10027<br>